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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001705`

染色体: Chr08 坐标: 14267237-14268512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001705`
名称	SmilChr08G001705
描述	DNA damage-repair/toleration protein DRT102
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14267237 - 14268512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001248`
GeneID	`131001248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001248`
原始查询	`SmilChr08G001705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA damage-repair/toleration protein DRT102
产物	DNA damage-repair/toleration protein DRT102
Arabidopsis	`AT3G04880` (DRT102) DNA-damage-repair/toleration protein (DRT102) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819648] identity=67.8; qcov=0.997; evalue=1.85e-153; confidence=high
Rice	`Os01g0542000` - identity=61; qcov=0.987; evalue=1.55e-125; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02502 (LacAB_rpiB); PF12973 (Cupin_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783566.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783566.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783566.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783566.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14267320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C25,C86
`Chr8:14267354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C64,C66,C8,D7
`Chr8:14267484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C55
`Chr8:14267484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:14267621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:14267626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:14267627`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr8:14267627`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr8:14267629`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr8:14267629`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr8:14267630`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr8:14267630`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783566.1

312 aa

156

312

LacAB_rpiB

Cupin_7

PF02502 LacAB_rpiB 15-142 aa PF12973 Cupin_7 206-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783566.1`	Pfam	`PF02502`	LacAB_rpiB	Family	15	142	2.9e-28	99.3	Ribose/Galactose Isomerase
`XP_057783566.1`	Pfam	`PF12973`	Cupin_7	Domain	206	285	1.4e-07	32.0	ChrR Cupin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927583.1
AATGGTTTCACTTACTTTTACTAAACACTAAAAATAAATACTAATAAAAATATGGAACATTTAAAAAAAGAAATATAGATACTAAAAGTTGAAACAGATGAAGTAATTTTTAAATGATTTGTTATATGAAATTTTATAAATAATCAGTGATCGGCGGATTGCTACAGTCATTCAATGTGGACATTTGGATATTATATAGATTCTTCATCTGCTGGCCTTATCTATTTGCAAATTGCATTTCCGAAGAGCTCAGTTAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001248
ATGGCGCAGATCGATCCGACTGCCACCAACAGCCCTATCAAAATCATAGCCGGAGCCGACGACTTCGGCTGCAGCATCAAGGACGCGCTGGTCGCGCAGCTCCGCTCCCTCAAGATTGAAGTCGAAGACCTCGGAACCTCCAAATATTACTCCGTTGGCGAGGAAATCGGCCGCCGCGTCAGCGAAGCCGCCAAGACCAACTCCACCATCGAAACCCGCGGCCTGGTGGCGTGCGGCACCGGCGTCGGCGTCGCCATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783566.1
MAQIDPTATNSPIKIIAGADDFGCSIKDALVAQLRSLKIEVEDLGTSKYYSVGEEIGRRVSEAAKTNSTIETRGLVACGTGVGVAIFANKFPGVYAATCLTPAEALNARSINNCNVLAVSGMSTAPEVAAEILTTFLNTPFKSPCPASGSNPWPDEIQSFLDGSVEEMAKIGGENTPAVDPPCFICSVAKCRQEKDFTPVDVMPGGSMIILRETPTSAIVRFKAGSVEPAHHHTFGHDLVVTKGKKCVWNLTKKEKYDLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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