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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001721`

染色体: Chr08 坐标: 14459388-14462359 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001721`
名称	SmilChr08G001721
描述	uncharacterized SmilChr08G001721
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14459388 - 14462359 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998105`
GeneID	`130998105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998105`
原始查询	`SmilChr08G001721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=27.5; qcov=0.594; evalue=2.53e-16; confidence=low
Rice	`Os04g0610000` - identity=28.1; qcov=0.807; evalue=5.04e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779523.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779523.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779523.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779523.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14460647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14460671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,B87,C87
`Chr8:14460672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B76,B87
`Chr8:14460677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:14460692`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A1,A9,B140,B4,B50,B64,B7,B71,B73,B74,B76,B77,C14,C24,C32,C39,C5,C51,C58,C73
`Chr8:14460744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B96
`Chr8:14460760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A11,A2,B112
`Chr8:14460760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A2,B112
`Chr8:14460780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	215	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B125,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C30,C32,C34,C36,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:14461015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B37,B99
`Chr8:14461016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:14461032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B54,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779523.1

374 aa

187

374

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 109-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779523.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	109	226	2.2e-22	80.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923540.1
TTGACCATAAAAAAAATATTGGCGCTCTAAATTCATTTAGGCGCCTTTTTCGAGATAATAAAATTTAAATATGCGCTAATTTTTTTCTTTCACAAGATCTGATTTCTATTCTTCATGAAATAGGAAGTTAATTCCTTATAAAATACCATTGGAGATAAGGAAAAAAGAAAAACCCTAGCAGTATTTATCCTACAATACGTCACTTTAGCATTCCACAGTTGAGGAAAAATCAGTCTCTGCCTAGACGATAACAGAGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998105
ATGGTCTTGGAACAAGATTCTGAAAACCACGTAATCGGGAGCAATGCTAAGTATTTTTCATCTCAGTTGGGTATTATGGCAAAAGATGGAAACAAATTGCCCCTTTCATATACTGATTGGAGGGCAGTGCCCAATACACAAAAGGATCTCATTTGGGATGACGTGAAGGAGAATACAAATTTAACAGACAACTACAAAAACAATTGTTTGAGGAAAATTGGAAAGTTGTGGAAGGATTGGAAAGGTCGGTTAAAAGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779523.1
MVLEQDSENHVIGSNAKYFSSQLGIMAKDGNKLPLSYTDWRAVPNTQKDLIWDDVKENTNLTDNYKNNCLRKIGKLWKDWKGRLKAKYYTPHRHDKSYVLSKCPQRVEPDQWPILVNYWSSNNAKKLSKTNRNSRKLVKLPPRMGRKDMAGAKDEYRREHGKEPSKLDLFIYSRQRKSEKPVDKNTEEKIARLKELKQKLPEELVDDIEANDAIFQEVIGREAPGCLRNSNIVSSKNLIYTSREEFDRAVQERTNGEIES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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