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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001729`

染色体: Chr08 坐标: 14538280-14540256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001729`
名称	SmilChr08G001729
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14538280 - 14540256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001274`
GeneID	`131001274`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001274`
原始查询	`SmilChr08G001729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT4G31980` (AT4G31980) PPPDE thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829328] identity=31.9; qcov=1.01; evalue=2.03e-57; confidence=low
Rice	`Os05g0242000` - identity=27.9; qcov=1.04; evalue=3.63e-40; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001274

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783600.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057783600.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783600.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783600.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14538540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B118
`Chr8:14538699`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	112	A10,A13,A14,A15,A16,A2,A22,A23,A24,A4,A5,A8,B102,B110,B117,B118,B119,B123,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B132,B133,B135,B137,B138,B140,B16,B20,B22,B26,B28,B29,B34,B40,B41,B42,B43,B47,B48,B52,B54,B57,B58,B6,B60,B62,B63,B65,B67,B7,B74,B76,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B93,B95,C13,C2,C21,C22,C24,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C4,C43,C44,C47,C49,C5,C53,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C65,C67,C68,C71,C72,C76,C81,C82,C83,C86,C87,D1,D10,D11,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:14538816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:14539086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B82,C20,C39,C48
`Chr8:14539198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:14539314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:14539366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B37,B89,C3
`Chr8:14539372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:14539378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:14539628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B95
`Chr8:14539679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B136,B45,B62,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783600.1

426 aa

213

426

DUF247

PF03140 DUF247 33-407 aa

XP_057783601.1

424 aa

212

424

DUF247

PF03140 DUF247 33-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783600.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	33	407	3.4e-101	340.2	Plant protein of unknown function
`XP_057783601.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	33	407	3.4e-101	340.2	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927618.1
ACTATCACGACAAAATCATTGGCACTTTCCTTGTTACAAGTAGCTTAAGAGTTATGAGGCATTTAAAGGGGTTAGGTTTGTTTGTTGAGTATGCAGCTGGCAAAATAAGACAACATCGCTCAAACCACACTCTCCTTAACCATGTCCCAGTCCCTTCTTGCATATATATAGATCCAACATCAAGCCAGGAATCAAGAAAACTCTGCAACTCAATCTACAAAACTCAACAAAAAAATGGCAGAAGAATCAGGGAAGGATGA...

XM_057927617.1
AGGTTTGTTTGTTGAGTATGCAGCTGGCAAAATAAGACAACATCGCTCAAACCACACTCTCCTTAACCATGTCCCAGTCCCTTCTTGCATATATATAGATCCAACATCAAGCCAGGAATCAAGAAAACTCTGCAACTCAATCTACAAAACTCAACAAAAAAATGGCAGAAGAATCAGGGAAGGATGAGCTGAGTGTCAACATTGATGAAATGCTCCATGAATTTTCCTACACAGCCTCAAGGCCCTCAACTCCCTTCATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001274
ATGGCAGAAGAATCAGGGAAGGATGAGCTGAGTGTCAACATTGATGAAATGCTCCATGAATTTTCCTACACAGCCTCAAGGCCCTCAACTCCCTTCATCTACAGAGTCACTGACAGCCTTCGCAGCACGAAAGAGACGGAGTATGATCCAATCATCATCTCCATCGGCCCGCTTCACCATGGAAAACACAACCTCCAAGCCATGGAGCCCCTCAAAATGTGGTACCTCAAGAAGCTACTTGGAGACTCCAGTGTTGACAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783600.1
MAEESGKDELSVNIDEMLHEFSYTASRPSTPFIYRVTDSLRSTKETEYDPIIISIGPLHHGKHNLQAMEPLKMWYLKKLLGDSSVDSYVQAIRSNEQTARDFYAEKIELNTDELVKMLLLDAIFIIQFLREYDKELGVQESKGDPIFGFEHVKSHILRDLMLFENQIPMFIVRDLFQLSNHDNQEFKYLFWPLFQHRRDVPTVLPEAHHLLGLVHAVKFCSSVQQLLRRIDKPIEMENILSATELRAAGILFKKNPENEN...

XP_057783601.1
MAEESGKDELSVNIDEMLHEFSYTASRPSTPFIYRVTDSLRSTKETEYDPIIISIGPLHHGKHNLQAMEPLKMWYLKKLLGDSSVDSYVQAIRSNEQTARDFYAEKIELNTDELVKMLLLDAIFIIQFLREYDKELGVQESKGDPIFGFEHVKSHILRDLMLFENQIPMFIVRDLFQLSNHDNQEFKYLFWPLFQHRRDVPTVLPEAHHLLGLVHAVKFCSSVQQLLRRIDKPIEMENILSATELRAAGILFKKNPENEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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