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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001731`

染色体: Chr08 坐标: 14553610-14559980 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001731`
名称	SmilChr08G001731
描述	uncharacterized SmilChr08G001731
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14553610 - 14559980 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001275`
GeneID	`131001275`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001275`
原始查询	`SmilChr08G001731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0594300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0594300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G04700` (AT1G04700) PB1 domain-containing protein tyrosine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839437] identity=77; qcov=0.268; evalue=8.33e-175; confidence=weak
Rice	`Os12g0594300` - identity=70; qcov=0.316; evalue=5.49e-175; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00564 (PB1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001275

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783602.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783602.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783602.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783602.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14555193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B82,C20,C48
`Chr8:14555290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:14555339`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,A25,B109,B75,C50,C65,C70,C72
`Chr8:14555341`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,A25,B109,B75,C50,C65,C70,C72
`Chr8:14555492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:14556544`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr8:14556544`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr8:14556760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:14556820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B136,B17,B61,C52
`Chr8:14556848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:14556885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B136,B17,B61,C52
`Chr8:14556973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783602.1

1185 aa

592

1185

PB1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00564 PB1 177-259 aa PF00069 Pkinase 906-1166 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 908-1168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783602.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	177	259	2.8e-19	69.6	PB1 domain
`XP_057783602.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	906	1166	8.9e-46	157.1	Protein kinase domain
`XP_057783602.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	908	1168	1.9e-62	211.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927619.1
GGGTTGGGTTCTGTGCATTGCATTTAGTTTTTATAGTTAAAAGTTGGTGCGATTATGGCGCCAATTATTTTTCTATATTTCCTATGCACAAATGTTTCGCTATTCCGAAACCCATGGAACGCCCCCTTTTCTCTCCACCAATCTTCGCCCCGCTACCAAACCCCAATTCTTCAACAATGATTTTCATCTTTTCTTTTCCTTTTCCCCTATGCCGAATTCCACCATAATTTTTTCCAGAAAAGATAGCAGAAAGATGGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001275
ATGGAGAGTAAGTTCTGCGGACAGACTGATGCTGATTCGCCCAGCTCGACACAAAGTAATCAAAACTGCGGAGTTAAAAGCCTGCGTAACATCTCTGTGCAAACAGGGGAGGAATTTTTAGATGAATTTTTGAAGGACCGCGTTGCATCTAGAAGAGTGCCTGTTGCAAATGATGTTGTACACAATCACCATGTTACAAGTCTTCATGATACTAGGAAAAAAGATACCGAGAGTTGTCCAGATTATGTAGATTTTTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783602.1
MESKFCGQTDADSPSSTQSNQNCGVKSLRNISVQTGEEFLDEFLKDRVASRRVPVANDVVHNHHVTSLHDTRKKDTESCPDYVDFSSGEGYGVDVNSKYYVNGSNAYYRELQANGQHHRKLSENFDRGGPSVPLGYSSESPHSNQSSSKGSGFTDSSFTGKLKFLCSFGGKILPRPNDGKLRYVGGDTRIVSLGKNATYLELLKKTMAIFKYHHTIKYQLPGEDLDALISVASDEDLHHMLEEYHELEKTSQRLRLFLVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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