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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001735`

染色体: Chr08 坐标: 14589670-14594584 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001735`
名称	SmilChr08G001735
描述	dihydroxy-acid dehydratase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14589670 - 14594584 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001279`
GeneID	`131001279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001279`
原始查询	`SmilChr08G001735`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydroxy-acid dehydratase, chloroplastic
产物	dihydroxy-acid dehydratase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G23940` (AT3G23940) dehydratase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821977] identity=79.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0559600` (Dad) - identity=85; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004160 (dihydroxy-acid dehydratase activity); GO:0009082 (branched-chain amino acid biosynthetic process); GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	smil00290 (Valine, leucine and isoleucine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00920 (ILVD_EDD_N); PF24877 (ILV_EDD_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783609.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057783609.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057783609.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783609.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14590150`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr8:14590150`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr8:14590152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:14590316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:14591041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:14592058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:14593943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A4,B124,B95
`Chr8:14594069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B118
`Chr8:14594282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:14594285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:14594286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:14594317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B121,B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783609.1

613 aa

306

613

ILVD_EDD_N

ILV_EDD_C

PF00920 ILVD_EDD_N 90-407 aa PF24877 ILV_EDD_C 419-609 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783609.1`	Pfam	`PF00920`	ILVD_EDD_N	Domain	90	407	1.5e-129	432.4	Dihydroxy-acid/6-phosphogluconate dehydratase N-terminal
`XP_057783609.1`	Pfam	`PF24877`	ILV_EDD_C	Domain	419	609	1.9e-74	249.9	Dihydroxy-acid/6-phosphogluconate dehydratase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927626.1
TAAAAGAGAACATATAGGCGGATATATAGCCCACAATACACTACTACGCACTGCTGTAACACACTCCCACCTAAACCCCAAATCATCCACCCGCCGCCGCCGTCCGCCGCCAAAATGCAGGCTTCCTTCCTCCTCTCCCAGCCGCCACCTGCCGCCGCCATCAAAACCCGCTCACTCTCCCCCCTTCATTTCAAAACTCCCTCCTCCCTCACCATCCACGCCTCCACCACCATAACCACCACAGAAACCGACGTCCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001279
ATGCAGGCTTCCTTCCTCCTCTCCCAGCCGCCACCTGCCGCCGCCATCAAAACCCGCTCACTCTCCCCCCTTCATTTCAAAACTCCCTCCTCCCTCACCATCCACGCCTCCACCACCATAACCACCACAGAAACCGACGTCCCGCCACCACCGCCCGCCACCGCAGTGAAACTGAATAAGTACAGCTCCAGAATCACGGAGCCCAAGTCGCAGGGCGGTTCTCAGGCGGTCCTCTACGGCGTCGGCCTCTCCGACGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783609.1
MQASFLLSQPPPAAAIKTRSLSPLHFKTPSSLTIHASTTITTTETDVPPPPPATAVKLNKYSSRITEPKSQGGSQAVLYGVGLSDDDLKKPQVGISSVWYEGNTCNMHLLKLAEAVKEGVTEAGMVGFRFNTIGVSDAISMGTRGMCYSLQSRDLIADSIETVMAAQWYDGNISIPGCDKNMPGTIMAMGRLNRPSIMVYGGTIKPGHFQGHTYDIVSAFQVYGEYVSGSVSDEQRVNVLRNSCPGAGACGGMYTANTMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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