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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001740`

染色体: Chr08 坐标: 14609729-14618353 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001740`
名称	SmilChr08G001740
描述	uncharacterized SmilChr08G001740
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14609729 - 14618353 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001284`
GeneID	`131001284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001284`
原始查询	`SmilChr08G001740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839431]; symbol=CTF18; hit=AT1G04730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839431]; symbol=CTF18; hit=AT1G04730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G04730` (CTF18) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839431] identity=58.2; qcov=0.887; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0264800` - identity=49.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783612.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783612.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783612.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783612.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14609893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C24,C71
`Chr8:14609899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B68
`Chr8:14610368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:14611370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:14612771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:14613145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,C64,C66,C8,D7
`Chr8:14614751`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B63,B83
`Chr8:14614751`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr8:14614762`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C3
`Chr8:14614762`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C3
`Chr8:14615373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B108,B113,C81
`Chr8:14615953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783612.1

978 aa

489

978

AAA

PF00004 AAA 365-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783612.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	365	455	4.1e-12	47.4	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927629.1
GCCGCTCTTATTCGTCTCCATTTCCCGCCAAACAAACACACACAGTCAGTCGCCGCCAAACAAACACACACAGTCGCTCACAGAGAGAGAGAGAGAGGCGCATTGGTATAGTCTGAGTCTGAGGAAGTGATGGATATTCCCGATTTGGAAGAGCTGGAATGGCTGGAATCCCATGCTCAGGACGACGATCAGTTCGACGATGATTTCGACCTCGATGTCGAACCGCCCTCACCCCCTTCATCACCCTCACAGCGCCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001284
ATGGATATTCCCGATTTGGAAGAGCTGGAATGGCTGGAATCCCATGCTCAGGACGACGATCAGTTCGACGATGATTTCGACCTCGATGTCGAACCGCCCTCACCCCCTTCATCACCCTCACAGCGCCCGCCCCTGTCTCTCCCGCCGAAGCCCTCACCTTTCAAACCCCAGCCCCAAATATACCCTACTTCCAACAAACGCGCCGGATCTGACCTCCTGAATTCGATATCCCTAGATGCAACCGACAATCACTACCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783612.1
MDIPDLEELEWLESHAQDDDQFDDDFDLDVEPPSPPSSPSQRPPLSLPPKPSPFKPQPQIYPTSNKRAGSDLLNSISLDATDNHYLDSNWANGKRSRNEEDEARHEKFALPECPDVSEENKEGSDDDKEWLRCSPPRDTFEEMEVVEDGEQERILSRYATEIDGDCVPITGLDGERVYAKICSSVEMDEEVRNKKLNFRRDHNGLLQEPVRVLMEKVEQEQFTKALQGSVEGDSTEVVPSTSPVTTEQLWVEKYAPSSFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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