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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001753`

染色体: Chr08 坐标: 14742343-14744700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001753`
名称	SmilChr08G001753
描述	60S ribosomal protein L13a-4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14742343 - 14744700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001297`
GeneID	`131001297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001297`
原始查询	`SmilChr08G001753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L13a-4
产物	60S ribosomal protein L13a-4
Arabidopsis	`AT5G48760` (AT5G48760) Ribosomal protein L13 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834934] identity=89.8; qcov=1; evalue=2.67e-139; confidence=high
Rice	`Os03g0756000` (OSJNBb0081K01.9) - identity=84.5; qcov=1; evalue=8.6e-132; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0017148 (negative regulation of translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00572 (Ribosomal_L13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783632.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057783632.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057783632.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057783632.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057783632.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14742665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:14742794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:14743776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:14744494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783632.1

206 aa

103

206

Ribosomal_L13

PF00572 Ribosomal_L13 11-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783632.1`	Pfam	`PF00572`	Ribosomal_L13	Family	11	115	1.4e-23	84.0	Ribosomal protein L13

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927649.1
TTTTGAAAAAAAAGAAAGAAAGTAAATTAGATATTCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAGTAAATAAGAGAAAACTAGAATGGGCTTTGGCCCAGATGGAAAGGAAGGCTGAGAATCCTTGTATGGAACCCAATTACATTTTAAGAACCCAACCCTAGAAAAACCCTACTTTGCTTTCACTACCACTGCACCACCCTTATAATCCTTCCGCCTCTGAGGAGAGAGAGAGAGAGAAGTGAAAGATAGTAGAGATGGTGTCAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001297
ATGGTGTCAGGTTCGGGTATCTGCGCGAAGAGAGTGGTGGTGGATGCTAGGAACCACATGCTGGGGCGGTTGGCGTCCATTCTCGCCAAGGAGTTGTTGAACGGCCAGAAAGTGGTGGTCGTCAGATGCGAGGAAATCTGCCTCTCCGGCGGCCTTGTTCGCCAGAAGATGAAGTACTTGAGATTCCTCCGCAAGCGGATGAACACTAAGCCCTCCCACGGACCCATTCATTTCCGCGCCCCTTCTAAGATTCTCTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783632.1
MVSGSGICAKRVVVDARNHMLGRLASILAKELLNGQKVVVVRCEEICLSGGLVRQKMKYLRFLRKRMNTKPSHGPIHFRAPSKILWRTIRGMIPHKTKRGEAALARLKVYEGVPPPYDKIKRMVIPDALKVLRLQAGHKYCLLGRLSSEVGWNHYDTIRELEKKRKDRAQATYERKKQLNKLRAKAEKVAMEKLGSQLDVIAPIKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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