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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001757`

染色体: Chr08 坐标: 14770486-14772419 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001757`
名称	SmilChr08G001757
描述	probable calcium-binding protein CML22
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14770486 - 14772419 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001300`
GeneID	`131001300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001300`
原始查询	`SmilChr08G001757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML22
产物	probable calcium-binding protein CML22
Arabidopsis	`AT3G24110` (AT3G24110) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821997] identity=52.2; qcov=0.792; evalue=2.21e-76; confidence=high
Rice	`Os05g0147300` - identity=45.1; qcov=0.74; evalue=1.72e-66; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783637.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057783637.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057783637.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057783637.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057783637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14771394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:14771566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B140,C37,C82
`Chr8:14771584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:14771594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C82
`Chr8:14771617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:14771664`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A11,A15,A20,A5,B10,B100,B112,B113,B124,B130,B136,B14,B20,B24,B27,B30,B36,B49,B53,B61,B70,B79,B80,B85,B97,B99,C10,C22,C24,C27,C30,C32,C33,C42,C51,C58,C61,C68,C77,C83
`Chr8:14771689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:14771820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B99,C87
`Chr8:14771946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783637.1

288 aa

144

288

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_7

EF-hand_5

PF13405 EF-hand_6 119-146 aa PF13202 EF-hand_5 120-144 aa PF13499 EF-hand_7 209-270 aa PF13202 EF-hand_5 253-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783637.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	119	146	6.7e-13	47.8	EF-hand domain
`XP_057783637.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	120	144	1.2e-06	28.5	EF hand
`XP_057783637.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	209	270	3.7e-17	63.1	EF-hand domain pair
`XP_057783637.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	253	270	1.2e-06	28.5	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927654.1
TGAGATTGAGACAAACAAAGTGGATTTCAGTAAAAGCCATGATTACATTTCCACTTGAGAAAGAAAAAAGGAAAAGGAAAGAAGAGAATATCAGATATCCTAATTCGAAAACCATTATTCCATGGACGAATTCCACATTTCTACTTTACTTTTCTTCTACCCAATTCCATTCTTTAACCTTCTTTACTGCTTAAATATAAAATATCTGCTTCTGCATTTGCTCTCTGTGATCTTAGGTCTCAAAGCCATGAGATATCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001300
ATGGACGAATTCCACATTTCTACTTTACTTTTCTTCTACCCAATTCCATTCTTTAACCTTCTTTACTGCTTAAATATAAAATATCTGCTTCTGCATTTGCTCTCTGTGATCTTAGGTCTCAAAGCCATGAGATATCCACAAGGACAAGGTGCATCTCAATCGCCCTTTAAGTCGTTATATGACAAGTTGCAAGACATACTTTGCTGTTCTACATTACCAAACAACTATAAGAGGCTAGACGCGACGCTTGAGAAGAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783637.1
MDEFHISTLLFFYPIPFFNLLYCLNIKYLLLHLLSVILGLKAMRYPQGQGASQSPFKSLYDKLQDILCCSTLPNNYKRLDATLEKKMMEIKRNPSRNHSFKSFDTIIMKFPQFREGLKEIRDIFEQYDEDFNGTIDNQELKKCLHAYEFSISDEEIGDLVGYCDIDEKEGIQLKEFIVLVFLIYLLTDAPAAPNTKLKMCSPQIEATFNAIIEVFVFLDKDGVGKLKKKDVVKALNEASPKEKSPSHITHSRFKEMDWDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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