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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001767`

染色体: Chr08 坐标: 14880301-14887726 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001767`
名称	SmilChr08G001767
描述	vicilin-like seed storage protein At2g18540
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14880301 - 14887726 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001310`
GeneID	`131001310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001310`
原始查询	`SmilChr08G001767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vicilin-like seed storage protein At2g18540
产物	vicilin-like seed storage protein At2g18540
Arabidopsis	`AT1G04850` (AT1G04850) ubiquitin-associated (UBA)/TS-N domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839399] identity=76.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0504500` - identity=71.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00627 (UBA); PF09409 (PUB); PF22562 (UBA_7); PF24560 (zf-C2H2_OTU1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057783652.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783652.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783652.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783652.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14881365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,B99,C87
`Chr8:14882551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B23,B34,C9
`Chr8:14882825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:14882848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:14882858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:14883308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:14884674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:14885043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:14887562`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B110
`Chr8:14887562`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783652.1

414 aa

207

414

zf-C2H2_OTU1_C

UBA

UBA_7

PUB

PF24560 zf-C2H2_OTU1_C 2-35 aa PF00627 UBA 114-150 aa PF22562 UBA_7 114-161 aa PF09409 PUB 320-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783652.1`	Pfam	`PF24560`	zf-C2H2_OTU1_C	Domain	2	35	1.3e-17	63.9	Ubiquitin thioesterase OTU1, C-terminal C2H2-type zinc finger
`XP_057783652.1`	Pfam	`PF00627`	UBA	Domain	114	150	7.9e-09	35.9	UBA/TS-N domain
`XP_057783652.1`	Pfam	`PF22562`	UBA_7	Domain	114	161	3.4e-19	69.2	UBA-like domain
`XP_057783652.1`	Pfam	`PF09409`	PUB	Domain	320	391	3.5e-25	88.5	PUB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927669.1
TCCCAAATTTTCGAACCTGATTTCATAGAAAAACCCTAGACACAAACACCAAAATTATCCAAAGCCGAGCGATCAACGAATCGGATGATTTCATTACCTAATAACTGATAGATTCTGCTCGGAGCGAAAACGAACTATGGCGGGGTTTTCATTGAAATGCGGGGATTGCGGGACGCTGCTGAAGTCAGTGGAGGAAGCCCAGGAGCACGCAGAGCTAACCAAACACACCAACTTCGTCGAATCTACGGAGGCCGTGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001310
ATGGCGGGGTTTTCATTGAAATGCGGGGATTGCGGGACGCTGCTGAAGTCAGTGGAGGAAGCCCAGGAGCACGCAGAGCTAACCAAACACACCAACTTCGTCGAATCTACGGAGGCCGTGCTCAATTTAGTCTGCGCCGATTGCGGGAAGCCGTGCCGCTCAAAAACCGAGAGTGATTTGCATACTAAGCGGACGGGACACACTGAGTTTGTGGACAAGACTTCAGAGGCAGCAAAACCTATAAGTTTGGAGGCTCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783652.1
MAGFSLKCGDCGTLLKSVEEAQEHAELTKHTNFVESTEAVLNLVCADCGKPCRSKTESDLHTKRTGHTEFVDKTSEAAKPISLEAPKPMDDVEMEEAGEGSSTQQEEMVVSDVNQQLLAELEEMGFPKERSTRALHFSGNESLEAAANWIVEHENDPDIDQMPLVPVNSKKPEAPKKALTPEEIKQKQHELRERARKKKEEEEKLKEREREKERIRIGKELLEAKRIEEDNERKRILALRKAEKEEEKRAREKIRQKLEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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