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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001770`

染色体: Chr08 坐标: 14907622-14913604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001770`
名称	SmilChr08G001770
描述	uncharacterized SmilChr08G001770
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14907622 - 14913604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001313`
GeneID	`131001313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001313`
原始查询	`SmilChr08G001770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007]; symbol=AT4G13730; hit=AT4G13730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007]; symbol=AT4G13730; hit=AT4G13730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13730` (AT4G13730) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007] identity=73.8; qcov=0.809; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0908100` - identity=71.4; qcov=0.743; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0090630 (activation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC); PF23436 (RabGap-TBC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783657.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783657.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057783657.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057783657.1`
5	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057783657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14907995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36
`Chr8:14908013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B134,B4,C36,C38
`Chr8:14908168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C37
`Chr8:14908209`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr8:14908209`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr8:14909490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:14910622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B108,B113,B78
`Chr8:14910628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D2
`Chr8:14910629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D2
`Chr8:14910644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:14910651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D2
`Chr8:14910652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783657.1

471 aa

236

471

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 244-436 aa PF23436 RabGap-TBC_2 275-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783657.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	244	436	2e-41	142.8	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057783657.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	275	448	2.2e-08	34.8	RabGAP TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927674.1
ACGTGACCACAACCAATCCACCTGGCAACCAAACTTCGTTCATCCCCACTCTCCCTCTCTCTCTCACACACGCACACAGAGGGGAATGCGCAGAAGGCAGAACTAATGAATGCGACGCTTTCACGAGAACGTGTTCGTTCACAGTGATCAAATGAAATCTTTTTCTCTAATCTTCATAGACTAATTCGACTCAATTCAATCTATTTCTCACCAAATCATTAGTCGATCGCGAATTACTGAGAAATTTCGCTCTGATTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001313
ATGGTGAAGAAAGGGGTGCCTGACTGGCTCAACAGCTCCCTTTGGTCTACACCTAATCCACCGCCATCGCCGCCGCCCAACGACGCCGTGAAGCCATCATCTGTCCCAGTGGTTGAGCCACCGCCGCCAGTGCCCCCGCCGGAGCCTCCGGCTGCTTCTTCTGTTCACGCTACTGGTGCTGCGAAGACGGAAATCAGGGATCCGCTCAGTGGCACTTACGGTAGTAATAGTAGTGTTTCTCACAGCGATGAGGAAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783657.1
MVKKGVPDWLNSSLWSTPNPPPSPPPNDAVKPSSVPVVEPPPPVPPPEPPAASSVHATGAAKTEIRDPLSGTYGSNSSVSHSDEENGSSSTSANSTASGGGAAAAVAPAPAPPAAEVISRQTQLLQELSRKVIIMGELRRLASEGIPDGAGIRSIVWKLLLGYLPPDRSLWPSELAKKRSQYKHFKEELLINPSEITRRLEKSSLDKNEPDGSPGFLSRSEITHGEHPLSLGQSSIWNQFFQDAEILEQIDRDVKRTHPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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