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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001780`

染色体: Chr08 坐标: 15008439-15010005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001780`
名称	SmilChr08G001780
描述	uncharacterized SmilChr08G001780
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15008439 - 15010005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998112`
GeneID	`130998112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998112`
原始查询	`SmilChr08G001780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0590366` - identity=31.7; qcov=0.564; evalue=8.36e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779530.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779530.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779530.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779530.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15008447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr8:15009063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20
`Chr8:15009063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:15009113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B30,D10
`Chr8:15009205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B21,B35,B62,C29
`Chr8:15009292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C10
`Chr8:15009437`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A2,A20,B6
`Chr8:15009455`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A1,A3,B104,B131,B79,B86,C11,C21,C23,D8
`Chr8:15009472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A3,A8,B104,B117,B12,B122,B131,B133,B40,B55,B86,C11,C21,C32,C33,C54,C68,C8,D8
`Chr8:15009473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	117	A11,A13,A19,A20,A22,A24,A4,A6,B10,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B117,B118,B119,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B16,B19,B21,B23,B24,B25,B26,B31,B34,B36,B42,B43,B45,B47,B48,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B61,B62,B64,B72,B73,B75,B76,B80,B81,B82,B83,B84,B88,B9,B91,B95,B97,B99,C11,C12,C13,C17,C2,C20,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C38,C39,C4,C40,C44,C50,C52,C53,C58,C59,C6,C68,C69,C71,C72,C74,C75,C76,C77,C8,C83,C87,C9,D6,D9
`Chr8:15009483`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A13,B129,B138,B139,B15,B19,B21,B27,B38,B39,B41,B64,B8,B83,B85,C20,C24,C36,C59,C62,C67,C81,C86,D2,D4
`Chr8:15009517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779530.1

296 aa

148

296

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779530.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	122	2.6e-07	32.2	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923547.1
ATGAGCTCCGCGACTCAAGGAAGCAATGGGTTTGCACGAGGTTGTCGCACCAAAAAAACAGATAAGAAGCGTCGAAGCTGGTCGACGAGCGAACAAGAAGTCCTATTGACTGCCTTGAAGGAGTTGGTCGCCCAAGGATGGAAATCCGATAACGGATTTCGCGCGGGATACTTGAAAAAGTTGGAGGAGGCAATGAAAAAGACATTTCCTACTACCGATGTGAAGGGCATGCCTCACAAAAACTCCAAGACGACCACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998112
ATGAGCTCCGCGACTCAAGGAAGCAATGGGTTTGCACGAGGTTGTCGCACCAAAAAAACAGATAAGAAGCGTCGAAGCTGGTCGACGAGCGAACAAGAAGTCCTATTGACTGCCTTGAAGGAGTTGGTCGCCCAAGGATGGAAATCCGATAACGGATTTCGCGCGGGATACTTGAAAAAGTTGGAGGAGGCAATGAAAAAGACATTTCCTACTACCGATGTGAAGGGCATGCCTCACAAAAACTCCAAGACGACCACGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779530.1
MSSATQGSNGFARGCRTKKTDKKRRSWSTSEQEVLLTALKELVAQGWKSDNGFRAGYLKKLEEAMKKTFPTTDVKGMPHKNSKTTTWKKDYYSLSLMLSNSGVGFNVDGKHMVDCTDEQWEAITKKDRNALNMRYKSWPYLDQWREIFGKDRATGEEVEDLMEAAHQMYHKIDLSQEQIDAPAKPRSQSLSCAHLAGRGSKRDESDKLFEVLAEIGHGTKERLDTIAGRMGYDYDVSAARKHMFSQLTAIPGLSQKAIFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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