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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001783`

染色体: Chr08 坐标: 15032977-15036647 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001783`
名称	SmilChr08G001783
描述	heat stress transcription factor A-5
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15032977 - 15036647 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001326`
GeneID	`131001326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001326`
原始查询	`SmilChr08G001783`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor A-5
产物	heat stress transcription factor A-5
Arabidopsis	`AT4G13980` (AT-HSFA5) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827033] identity=51.9; qcov=0.946; evalue=6.15e-153; confidence=high
Rice	`Os02g0496100` (HSFA5) - identity=47.5; qcov=0.966; evalue=2.35e-126; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783671.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783671.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783671.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783671.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15033402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B23,B52,D1
`Chr8:15033449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:15033482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:15033590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:15035012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B70,B78,C58
`Chr8:15035141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:15035211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C53
`Chr8:15035509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:15035618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B68
`Chr8:15035836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:15035903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B68
`Chr8:15035999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783671.1

507 aa

254

507

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 20-109 aa

XP_057783672.1

497 aa

248

497

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 20-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783671.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	20	109	3.7e-29	101.9	HSF-type DNA-binding
`XP_057783672.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	20	109	3.6e-29	102.0	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927688.1
CACGTAACATATGTTATAGTTATGGAGCCAAATCAACGGCTGGGATGCTGTCGTTGGTTTAAGATCGAAAATGGGCGGCTGAGATGAAATGGGTTTGGTACATTTGGTTTCTTCAGTTGGGGGTCAGGTCAACCACCGATGAAAGCTTCTTTTTTTTTTTGAGAAAAACCACGGATGATTCGATGAAAGCTTTATTCGGGAAAGAATAATTAATTTTTTTTGACAACGGAAAGAGTAATTAATTACTACTCCTACTACTA...

XM_057927689.1
CACGTAACATATGTTATAGTTATGGAGCCAAATCAACGGCTGGGATGCTGTCGTTGGTTTAAGATCGAAAATGGGCGGCTGAGATGAAATGGGTTTGGTACATTTGGTTTCTTCAGTTGGGGGTCAGGTCAACCACCGATGAAAGCTTCTTTTTTTTTTTGAGAAAAACCACGGATGATTCGATGAAAGCTTTATTCGGGAAAGAATAATTAATTTTTTTTGACAACGGAAAGAGTAATTAATTACTACTCCTACTACTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001326
ATGGACGGAGGAGCTTCCGGTGGCATGGCAACGGGAGGCGGCGGCGGTCCGGCACCTTTCCTGCTGAAAACGTATGAGATGGTGGACGACTCGTCGACGGATGCGATCGTCTCATGGAGCGGGAGCAGGAAGAGCTTCGTGGTCTGGAATCCACCGGAATTCGCCCGCGTCCTCCTCCCTTCTTACTTCAAGCACAACAATTTCTCCAGCTTCATCCGCCAGCTTAACACCTACGGATTCAGGAAGATTGATCCTGAGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783671.1
MDGGASGGMATGGGGGPAPFLLKTYEMVDDSSTDAIVSWSGSRKSFVVWNPPEFARVLLPSYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKIDPERWEFANDEFVKDQKHLLKNIHRRKPIHSHSQPQGSVDPERATYEEEIDKLSREKAALEGNLLGFKEQQSAAKVQLEDLTQRIGSMEQRQEKLLSYLNKSIRNPEFVERLAHKLESMDFSAYNKKRRLPQADDDVQSIQETVSVDNQSSCRPEFDCTDQDFCNKLRLELSTAVSD...

XP_057783672.1
MDGGASGGMATGGGGGPAPFLLKTYEMVDDSSTDAIVSWSGSRKSFVVWNPPEFARVLLPSYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKIDPERWEFANDEFVKDQKHLLKNIHRRKPIHSHSQPQGSVDPERATYEEEIDKLSREKAALEGNLLGFKEQQSAAKVQLEDLTQRIGSMEQRQEKLLSYLNKSIRNPEFVERLAHKLESMDFSAYNKKRRLPQADDDVQSIQETVSVDNQSSCRPEFDCTDQDFCNKLRLELSTAVSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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