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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001790`

染色体: Chr08 坐标: 15085488-15089309 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001790`
名称	SmilChr08G001790
描述	receptor-like kinase TMK4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15085488 - 15089309 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001333`
GeneID	`131001333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001333`
原始查询	`SmilChr08G001790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like kinase TMK4
产物	receptor-like kinase TMK4
Arabidopsis	`AT3G23750` (AT3G23750) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821957] identity=61.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0717000` (OsTMK) - identity=51.2; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783683.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783683.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783683.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783683.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15085831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:15086123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B72,B88,C41,C76
`Chr8:15086232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:15086976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:15087116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B38,B39
`Chr8:15087181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr8:15087339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:15087477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:15087574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:15087640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:15087985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:15088010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B72,B88,C41,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783683.1

922 aa

461

922

LRRNT_2

LRR_1

LRRNT_2

LRR_4

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 22-57 aa PF00560 LRR_1 109-127 aa PF00560 LRR_1 183-204 aa PF08263 LRRNT_2 320-358 aa PF12799 LRR_4 386-426 aa PF00560 LRR_1 387-409 aa PF00560 LRR_1 411-429 aa PF00069 Pkinase 575-847 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 577-847 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	22	57	8.7e-07	29.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	109	127	9e-16	55.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	183	204	9e-16	55.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	320	358	8.7e-07	29.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	386	426	2.1e-21	76.2	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	387	409	9e-16	55.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	411	429	9e-16	55.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	575	847	2e-45	155.9	Protein kinase domain
`XP_057783683.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	577	847	8.2e-49	167.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927700.1
ATTTAAAAAAACAAGTTCCGCCCACCCTTGAAGCAGGTGTGCGCCATACACAAAAACACAATTACAAATACAGATACTAATAAAAACATAGGCAGCCGCAAAACACAACACAACTCAACTTTCTTCTTCTCCTTCTCTCTCCATCAGCCCCCATGGCCACGCGCCACCGCGGCCTCCGCCTCCTCTCCTTCCTCAGCCTCATTTGCCTCTCCGCCGCGGACGACTCCGCCGCCATGTCCAAGCTCCTGTCCTCCCTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001333
ATGGCCACGCGCCACCGCGGCCTCCGCCTCCTCTCCTTCCTCAGCCTCATTTGCCTCTCCGCCGCGGACGACTCCGCCGCCATGTCCAAGCTCCTGTCCTCCCTCTCCACGCCCCCTCGCGGCTGGTCCTCCTCCGCCCACTTCTGCACCTGGAACAACGTCAAGTGCGACTCCACCAACTCCTTCGTCACCAGCATTAACCTCGACTCCGCCGCCGTCTCCGGCACTCTGCCTCCCGAAACCAACCAGCTCTCCCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783683.1
MATRHRGLRLLSFLSLICLSAADDSAAMSKLLSSLSTPPRGWSSSAHFCTWNNVKCDSTNSFVTSINLDSAAVSGTLPPETNQLSQLQSLAVQQNSLTGALPSFQNMTSLEQLYLDNNDFTSIPNNFLAGLTNLQVFSISENNKLASWQIPTYLTDSSNLVKFYASNASINGVIPDIFDSFPNLQDLRLSYNNLTGSLPGSFSGSEIRNLWLNNQDQGLSGSIDVLSDMSQLSQVWLHANAFSGGIPDLSKCTNLFDLQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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