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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001818`

染色体: Chr08 坐标: 15343150-15345657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001818`
名称	SmilChr08G001818
描述	uncharacterized SmilChr08G001818
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15343150 - 15345657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998117`
GeneID	`130998117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998117`
原始查询	`SmilChr08G001818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=33.7; qcov=0.11; evalue=3.81e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779534.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779534.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057779534.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057779534.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057779534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15343308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B50,B61,C25,C47
`Chr8:15343381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:15343616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:15343642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:15343797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,B10,B48,B54,B62,B8,C32,C43,D5
`Chr8:15343801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B71
`Chr8:15343829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B126,B47,B73,B83
`Chr8:15343850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C75
`Chr8:15343863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C29
`Chr8:15344109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr8:15344161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B6,B64
`Chr8:15344207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779534.1

835 aa

418

835

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 629-723 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779534.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	629	723	1.1e-06	30.0	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923551.1
ATGCCTCGTTCTTCTCGTACAGGCGTATTAGTTTTTGATCCAGAAATCGAGAAGACCACACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAGATCCAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGAAATTGAAGATCCAATGGGTGACCGTAATAATAGGGATGAGGAGAACGATAGAGAGATCGTTGATCCTCGACAGGAACCACCTCAACTGATCAGAGAGTTAGGCCGTCATAGAAGCAATCGCCCTTTGTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998117
ATGCCTCGTTCTTCTCGTACAGGCGTATTAGTTTTTGATCCAGAAATCGAGAAGACCACACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAGATCCAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGAAATTGAAGATCCAATGGGTGACCGTAATAATAGGGATGAGGAGAACGATAGAGAGATCGTTGATCCTCGACAGGAACCACCTCAACTGATCAGAGAGTTAGGCCGTCATAGAAGCAATCGCCCTTTGTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779534.1
MPRSSRTGVLVFDPEIEKTTRKLKKQAKEWKKRSNSAPPSLEEIEDPMGDRNNRDEENDREIVDPRQEPPQLIRELGRHRSNRPLCIVLPAINGNAEIRPGFIQVLPKFGDLPGESAHKHLAEFDLVCSTLRPHGFTENNLRLLTFSHTLQGRARDWLFDLPPGSIRTWGDLEEQFLRKFFPESRAANLRMAISSIKQKKAESLADYWERFQQLCRKCPDHGFSDYQLLTNYFYRGMSSFDRKIIDAACGGSLTNKTLDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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