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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G001830

染色体: Chr08 坐标: 15682249-15684994 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G001830
名称SmilChr08G001830
描述uncharacterized SmilChr08G001830
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向15682249 - 15684994 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131001363
GeneID131001363
locus_tag-
NCBI NameLOC131001363
原始查询SmilChr08G001830

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826436]; symbol=AT4G08690; hit=AT4G08690; species=arabidopsis; confidence=high
产物Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826436]; symbol=AT4G08690; hit=AT4G08690; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT4G08690 (AT4G08690)
Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826436]
identity=67.3; qcov=0.813; evalue=4.42e-131; confidence=high
RiceOs02g0752000
-
identity=61.6; qcov=0.921; evalue=1.57e-124; confidence=high
GOGO:0008526 (phosphatidylinositol transfer activity)
KEGG-
PfamPF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131001363

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057783716.1
2 Golgi apparatus 高尔基体 0.20000 XP_057783716.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057783716.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057783716.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057783716.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:15684673 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr8:15684764 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B1,B139
Chr8:15684804 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B72
Chr8:15684815 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B72
Chr8:15684849 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783716.1
305 aa
N
1
152
305
CRAL_TRIO_N
CRAL_TRIO
C
PF03765 CRAL_TRIO_N 48-71 aa PF00650 CRAL_TRIO 95-244 aa
XP_057783717.1
305 aa
N
1
152
305
CRAL_TRIO_N
CRAL_TRIO
C
PF03765 CRAL_TRIO_N 48-71 aa PF00650 CRAL_TRIO 95-244 aa
XP_057783718.1
305 aa
N
1
152
305
CRAL_TRIO_N
CRAL_TRIO
C
PF03765 CRAL_TRIO_N 48-71 aa PF00650 CRAL_TRIO 95-244 aa
XP_057783719.1
305 aa
N
1
152
305
CRAL_TRIO_N
CRAL_TRIO
C
PF03765 CRAL_TRIO_N 48-71 aa PF00650 CRAL_TRIO 95-244 aa
XP_057783720.1
305 aa
N
1
152
305
CRAL_TRIO_N
CRAL_TRIO
C
PF03765 CRAL_TRIO_N 48-71 aa PF00650 CRAL_TRIO 95-244 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057783716.1 Pfam PF03765 CRAL_TRIO_N Domain 48 71 5.1e-08 33.7 CRAL/TRIO, N-terminal domain
XP_057783716.1 Pfam PF00650 CRAL_TRIO Domain 95 244 1.1e-35 123.5 CRAL/TRIO domain
XP_057783717.1 Pfam PF03765 CRAL_TRIO_N Domain 48 71 5.1e-08 33.7 CRAL/TRIO, N-terminal domain
XP_057783717.1 Pfam PF00650 CRAL_TRIO Domain 95 244 1.1e-35 123.5 CRAL/TRIO domain
XP_057783718.1 Pfam PF03765 CRAL_TRIO_N Domain 48 71 5.1e-08 33.7 CRAL/TRIO, N-terminal domain
XP_057783718.1 Pfam PF00650 CRAL_TRIO Domain 95 244 1.1e-35 123.5 CRAL/TRIO domain
XP_057783719.1 Pfam PF03765 CRAL_TRIO_N Domain 48 71 5.1e-08 33.7 CRAL/TRIO, N-terminal domain
XP_057783719.1 Pfam PF00650 CRAL_TRIO Domain 95 244 1.1e-35 123.5 CRAL/TRIO domain
XP_057783720.1 Pfam PF03765 CRAL_TRIO_N Domain 48 71 5.1e-08 33.7 CRAL/TRIO, N-terminal domain
XP_057783720.1 Pfam PF00650 CRAL_TRIO Domain 95 244 1.1e-35 123.5 CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XM_057927734.1
GGCTGCTTGCATCTTCCTTGTCGGCTTCTTCAATCTCAACCACATAATTGCAACTGCCACTGCACACTTTGTCTGAGTTATTGTTCTTTTCTTCCATATTTTCTTTGACTAAAGTTGATTAGCATTGTACATCAAATATCGAGTTTCTCTATACGTAGTATTTATTGTACAATTCCGTTTTCTTAGTTAATACTAGCCTCAAAAGTTGAGTGATTGATACATGCACAGAATCATCGAATCCTCCAAATTTTGTACGTATA...
XM_057927736.1
GAGTTATTGTTCTTTTCTTCCATATTTTCTTTGACTAAAGTTGATTAGCATTGTACATCAAATATCGAGTTTCTCTATACGTAGTATTTATTGTACAATTCCGTTTTCTTAGTTAATACTAGCCTCAAAAGTTGAGTGATTGATACATGCACAGAATCATCGAATCCTCCAAATTTTTTTCTGGAAAGAGATCACGATCTTCATAAACCAATTAATTTATTCTGGGTAACCAAGCACGACCACAGAATTGACAAGTATGA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA
LOC131001363
ATGAGTAATGTGAGTAATGGGCAAAAGAAATCCACTCCAGATGAGTGCGAAAATTCTTCACCTCCTGAAATGGAGCAAGCTAAGATTAATGAGGTGAGACAGCTAATCGGGCCACTGTCTGGTAACCTCGCGGTTTATTGCTCTGATGCATCTATTTCAAGATATTTGAGAGCACGAAACTGGAATGTTAAGAAGGCCGTTAAAATGCTTAAAGCAACTCTAAAATGGAGGGAGGAGTTCAAGCCAGAAGAGATTTGTTG...
LOC131001363
ATGAGTAATGTGAGTAATGGGCAAAAGAAATCCACTCCAGATGAGTGCGAAAATTCTTCACCTCCTGAAATGGAGCAAGCTAAGATTAATGAGGTGAGACAGCTAATCGGGCCACTGTCTGGTAACCTCGCGGTTTATTGCTCTGATGCATCTATTTCAAGATATTTGAGAGCACGAAACTGGAATGTTAAGAAGGCCGTTAAAATGCTTAAAGCAACTCTAAAATGGAGGGAGGAGTTCAAGCCAGAAGAGATTTGTTG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA
XP_057783716.1
MSNVSNGQKKSTPDECENSSPPEMEQAKINEVRQLIGPLSGNLAVYCSDASISRYLRARNWNVKKAVKMLKATLKWREEFKPEEICWDDVAGEAETGKIYISNYKDKNGRSVLVMRPRCQNSKSIKGQIKYLVYCMENAILDLPPEQDQMIWLIDFHGFNVSHISIKVTRETAHVLQEHYPERLGVAILYDAPKIFQPFWMVAKPFLEPKTANKVNFVYADDPNTNKIMSELFDMEMVESAFGGKDDSDFNITKYAERMR...
XP_057783717.1
MSNVSNGQKKSTPDECENSSPPEMEQAKINEVRQLIGPLSGNLAVYCSDASISRYLRARNWNVKKAVKMLKATLKWREEFKPEEICWDDVAGEAETGKIYISNYKDKNGRSVLVMRPRCQNSKSIKGQIKYLVYCMENAILDLPPEQDQMIWLIDFHGFNVSHISIKVTRETAHVLQEHYPERLGVAILYDAPKIFQPFWMVAKPFLEPKTANKVNFVYADDPNTNKIMSELFDMEMVESAFGGKDDSDFNITKYAERMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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