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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001841`

染色体: Chr08 坐标: 15783262-15787276 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001841`
名称	SmilChr08G001841
描述	uncharacterized SmilChr08G001841
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15783262 - 15787276 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001384`
GeneID	`131001384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001384`
原始查询	`SmilChr08G001841`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816746]; symbol=AT2G22120; hit=AT2G22120; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816746]; symbol=AT2G22120; hit=AT2G22120; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G22120` (AT2G22120) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816746] identity=81; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0604600` - identity=79.7; qcov=0.975; evalue=7.87e-177; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	1.00000	`XP_057783745.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057783746.1`
3	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057783745.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057783746.1`
5	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057783745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15783552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:15783567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B44,C30,C57,C70
`Chr8:15786858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783745.1

327 aa

164

327

RINGv

PF12906 RINGv 35-82 aa

XP_057783746.1

323 aa

162

323

RINGv

PF12906 RINGv 35-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783745.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	35	82	1.9e-10	41.4	RING-variant domain
`XP_057783746.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	35	82	1.9e-10	41.5	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927762.1
CATCTCACTAGTAAATATTGCTTTGAATTATTCGATTCATCTTATACTACACCTCACTTCACTTTTCAACGCGATTGAATTCCGAAACCCCTTTTCATTTTCTTCAATCTTCAGTTTATGCTCTAACATTTTTGTGTTGAGGAATCCAATAACCGTGCAATCGTATGCGAATTTCCAAAGGGGGTCTTTTTGGTACCTCCTTGTGAAGTTTCATTCGAATTGGTTAATTCTAGCGTCGGGAATTGTGTTAAGATGGGTGT...

XM_057927763.1
CATCTCACTAGTAAATATTGCTTTGAATTATTCGATTCATCTTATACTACACCTCACTTCACTTTTCAACGCGATTGAATTCCGAAACCCCTTTTCATTTTCTTCAATCTTCAGTTTATGCTCTAACATTTTTGTGTTGAGGAATCCAATAACCGTGCAATCGTATGCGAATTTCCAAAGGGGGTCTTTTTGGTACCTCCTTGTGAAGTTTCATTCGAATTGGTTAATTCTAGCGTCGGGAATTGTGTTAAGATGGGTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001384
ATGGGTGTGGAGCAATCTGATTCCTTACCGCTGATGGCGCCGGCTCCAATCGCCGCCCCCTCTGAGATTGACCTTGAGGCCGGCCCTGATGAGCAAATTCAGTGCCGGATTTGCCTTGAAACTGACGGTAGGGATTTTATTGCTCCTTGCAAGTGCAAAGGCACATCAAAGTACGTTCACAGGGAATGCCTGGATCATTGGCGTGCCGTAAAGGAAGGGTTTGCCTTTGCTCATTGCACGACTTGCAAGGCTCCGTATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783745.1
MGVEQSDSLPLMAPAPIAAPSEIDLEAGPDEQIQCRICLETDGRDFIAPCKCKGTSKYVHRECLDHWRAVKEGFAFAHCTTCKAPYYIRVHGVADRKWRTMKFRFFVTRDILFIFFSVQLVIALLAYSMYLIDRYQKFWLRHIWGFDSELSFYYICGALLFFALLGLSGCFITCYDRRVRNDLAQPCRELCVSCCHPGVCADCHLPGTLCMWTDCTTCFESCAGAATECGWLGGAGEAGLPLLLVVAIIVLGLFTIIGIF...

XP_057783746.1
MGVEQSDSLPLMAPAPIAAPSEIDLEAGPDEQIQCRICLETDGRDFIAPCKCKGTSKYVHRECLDHWRAVKEGFAFAHCTTCKAPYYIRVHGVADRKWRTMKFRFFVTRDILFIFFSVQLVIALLAYSMYLIDRYQKFWLRHIWGFDSELSFYYICGALLFFALLGLSGCFITCYDRRVRNDLAQPCRELCVSCCHPGVCADCHLPGTLCMWTDCTTCFESCAGAATECGWLGGAGEAGLPLLLVVAIIVLGLFTIIGIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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