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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001842`

染色体: Chr08 坐标: 15805048-15805990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001842`
名称	SmilChr08G001842
描述	uncharacterized SmilChr08G001842
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15805048 - 15805990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001385`
GeneID	`131001385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001385`
原始查询	`SmilChr08G001842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814644]; symbol=RHA2B; hit=AT2G01150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RING-H2 finger protein 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814644]; symbol=RHA2B; hit=AT2G01150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01150` (RHA2B) RING-H2 finger protein 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814644] identity=56; qcov=0.318; evalue=2.74e-15; confidence=low
Rice	`Os04g0579200` - identity=38; qcov=0.637; evalue=4.18e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057783747.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057783747.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057783747.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057783747.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15805248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:15805283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:15805565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B123,C24,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783747.1

157 aa

157

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 70-98 aa PF13923 zf-C3HC4_2 70-112 aa PF13639 zf-RING_2 70-113 aa PF13445 zf-RING_UBOX 71-110 aa PF00097 zf-C3HC4 71-112 aa PF12678 zf-rbx1 76-113 aa PF12861 zf-ANAPC11 88-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	70	98	7.1e-09	35.9	RING-like zinc finger
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	70	112	2.9e-08	34.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	70	113	9.2e-14	52.2	Ring finger domain
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	71	110	1.1e-06	29.2	RING-type zinc-finger
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	71	112	2.5e-07	31.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	76	113	3.8e-08	34.2	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057783747.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	88	114	8.2e-06	26.5	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927764.1
TTATTATTTTGGTTTGTTCACAATATCATTTTCACTTTTATTTATAATATATAATATGATCAACAAACTCCACTTACAATAAAACACGTGTCGTCTACAAAATGAAAACGATATCATGAATGGATTGCATTTGATGCAAAATACATAAGGAATTATTAAATTTAAACTTGAAATATTTGATCTGAGAAATACCTCTCATTCCACTTGAGAGCTTACAATAGATATGTTTTAGTGATTAAAAAGTCAGGAGTCTGACTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001385
ATGGCATCCCTATCTCAAATCTGTGCTCATATCTACACCATGGCAATGCTCTTCTTCTCCATCCTCCTCCTCGAGCTCGCCATCCTCGTCCGCGGCGCCGCCCGGGCCACCCCCCGCCGCTCCCTCACCACCGATCAATTCCTCAAAATCATCGATCAAAAGGCTCCGGCACGGCGGTACGCGGCGGGGCTGGGGTTCGAAACCTCGGAGTGCAGTGTTTGCCTATGCCTCTACGAGGATGGAGACGAGGTGAGGAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783747.1
MASLSQICAHIYTMAMLFFSILLLELAILVRGAARATPRRSLTTDQFLKIIDQKAPARRYAAGLGFETSECSVCLCLYEDGDEVRKLKCKHTFHKGCVDTWLQQDSATCPLCRRPVLPVDVVLKHRNHRLQEYYDGGDEELMMMLYALHGNFLRRFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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