当前解析结果
SmilChr08G001847| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001847 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001847 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001847 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 15837453 - 15839071 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998120 |
|---|---|
| GeneID | 130998120 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998120 |
| 原始查询 | SmilChr08G001847 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=36; qcov=0.458; evalue=1.92e-41; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998120 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779537.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057779537.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779537.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779537.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779537.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:15837493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr8:15837558 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr8:15837772 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr8:15837824 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B73,C64 |
Chr8:15837830 |
A |
AAT |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 2 | C2,C5 |
Chr8:15837830 |
A |
AAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C2,C5 |
Chr8:15837891 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C5 |
Chr8:15837957 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:15838010 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B73 |
Chr8:15838162 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B86 |
Chr8:15838502 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr8:15838521 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C45 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。