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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001849`

染色体: Chr08 坐标: 15846599-15855716 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001849`
名称	SmilChr08G001849
描述	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	15846599 - 15855716 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001391`
GeneID	`131001391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001391`
原始查询	`SmilChr08G001849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
产物	protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1-like
Arabidopsis	`AT2G22125` (CSI1) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816747] identity=79.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0223800` (CSIL1) - identity=79.9; qcov=0.486; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0008017 (microtubule binding); GO:0010330 (cellulose synthase complex); GO:0051211 (anisotropic cell growth); GO:2001006 (regulation of cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF00514 (Arm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783755.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057783755.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057783755.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783755.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:15849837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:15850208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:15850321`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr8:15850321`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr8:15850933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B32
`Chr8:15851256`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr8:15851256`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23
`Chr8:15851452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B123,C24,C56
`Chr8:15851722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B69,C56,C57,C76
`Chr8:15852314`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr8:15852314`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr8:15853493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783755.1

2130 aa

1065

2130

Arm

PF00514 Arm 503-542 aa PF00168 C2 2003-2097 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783755.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	503	542	3.9e-47	157.6	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057783755.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	2003	2097	3.7e-12	47.1	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927772.1
CTCTCTCTTCCACACACACTGTCACTCTTCTTCTCTCACATATACATTACATACAGACACATCACAATACACTCTCTTTCTCTCTCTAAGCAATCTATTCTCCTCGCGTGTCAGCTACGAAACTCTCGATTTGATTTCATTTTAGAAAGAGAGAGAGAGAGCGAGGAGAGAGTTGCTAAAAGAGAGGGATAGAGCAGATTCCATCTCACCATTCTCGCTCTACATTTGTAGAAGCTCACCAACATTGTTGAAGAAGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001391
ATGGAGAGAAATGGGGAAGGTAGACCTCATGACTCAGAACCTCCTACCCCCCATGCACTCATGAAAATGGGTTCAAGAGATCGAGGTAGCATGGAGGACCCAGATGGAACATTAGCAAGTGTTGCACAATGTATTGAGCAATTGCGGCAGAGTTCCTCATCATCACAGGAAAAAGAGAAATGCTTGAGGCAATTACTTGAGTTAATCAACACAAGGGAAAATGCTTTTGGTGCAGTTGGATCACATTCGCAAGCGGTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783755.1
MERNGEGRPHDSEPPTPHALMKMGSRDRGSMEDPDGTLASVAQCIEQLRQSSSSSQEKEKCLRQLLELINTRENAFGAVGSHSQAVPVLVSLLRSGSLGIKIQSAVVLGSLCKENELRVKVLLGGCIPPLLGLLKSNSREGQIAAAKTIYAVSQGGAKDHVGSKIFSTEGVVPALWQQLDKGLKAGNEVDHLLTGALRNLCSSTEGFWPATIQAGGVDVLVKLLTTGQSSTQANVCFLLASMMMEDASICSKILAAEATK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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