当前解析结果
SmilChr08G001862| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001862 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001862 |
| 描述 | putative ETHYLENE INSENSITIVE 3-like 4 protein |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 15982735 - 15984405 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998122 |
|---|---|
| GeneID | 130998122 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998122 |
| 原始查询 | SmilChr08G001862 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative ETHYLENE INSENSITIVE 3-like 4 protein |
| 产物 | putative ETHYLENE INSENSITIVE 3-like 4 protein |
| Arabidopsis | AT5G10120 (AT5G10120)Ethylene insensitive 3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830876] identity=57; qcov=0.818; evalue=7.63e-134; confidence=high |
| Rice | Os03g0324200 (EIL1)- identity=59.5; qcov=0.572; evalue=7.25e-101; confidence=medium |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus) |
| KEGG | smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF04873 (EIN3_DNA-bd); PF27048 (EIN3_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998122 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779539.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779539.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779539.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779539.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779539.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:15983193 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C46 |
Chr8:15983235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:15983298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B4,B54,B58,C31 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779539.1PF27048
EIN3_N 59-128 aa
PF04873
EIN3_DNA-bd 141-265 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779539.1 |
Pfam | PF27048 |
EIN3_N | Domain | 59 | 128 | 1.1e-38 | 131.4 | Ethylene insensitive 3, N-terminal domain |
XP_057779539.1 |
Pfam | PF04873 |
EIN3_DNA-bd | Domain | 141 | 265 | 2.1e-63 | 212.6 | Ethylene insensitive 3, DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。