当前解析结果
SmilChr08G001867| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001867 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001867 |
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor RAP2-4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 16026674 - 16028158 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001407 |
|---|---|
| GeneID | 131001407 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001407 |
| 原始查询 | SmilChr08G001867 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor RAP2-4-like |
| 产物 | ethylene-responsive transcription factor RAP2-4-like |
| Arabidopsis | AT1G78080 (RAP2.4)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844143] identity=47.7; qcov=1.17; evalue=3.41e-69; confidence=high |
| Rice | Os03g0191900 (OsERF#047)- identity=40.4; qcov=1.1; evalue=3.74e-53; confidence=medium |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00847 (AP2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001407 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783777.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783777.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783777.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783777.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057783777.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783777.1PF00847
AP2 123-172 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783777.1 |
Pfam | PF00847 |
AP2 | Domain | 123 | 172 | 6.6e-16 | 59.1 | AP2 domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。