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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001873`

染色体: Chr08 坐标: 16216079-16217182 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001873`
名称	SmilChr08G001873
描述	PLAT domain-containing protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16216079 - 16217182 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001411`
GeneID	`131001411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001411`
原始查询	`SmilChr08G001873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLAT domain-containing protein 3-like
产物	PLAT domain-containing protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G22170` (PLAT2) Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816751] identity=50; qcov=0.933; evalue=5.75e-52; confidence=high
Rice	`Os06g0221300` - identity=44.9; qcov=0.928; evalue=2.62e-44; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01477 (PLAT); PF06232 (ATS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057783781.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057783781.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783781.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783781.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16216748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C25
`Chr8:16216792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B74,C2,C25,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783781.1

180 aa

180

ATS3

PLAT

PF06232 ATS3 27-130 aa PF01477 PLAT 36-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783781.1`	Pfam	`PF06232`	ATS3	Domain	27	130	1.6e-09	38.4	Embryo-specific protein 3, (ATS3)
`XP_057783781.1`	Pfam	`PF01477`	PLAT	Domain	36	150	3e-08	35.1	PLAT/LH2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927798.1
TTGTATTTATAGGGAGGTAGATGAGCATAGTAACACACACCTCAATAATTTACACAATAAACAAACAAAAAAAAAAATGAATCCGAAGAAAGTCATGGGGTTGAAGTATCTCATCTTCAATCTCCTCATCCTATTCTTCTTCTTCATCTACGCAAGTGCAGCTGATGAGGCAGAATGTGTGTACGGCATATACGTGCAAACGGGGTCAGTGAAAAAGGCCGGGACTCACTCCAAGATAAGCCTGACCCTATCCGACGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001411
ATGAATCCGAAGAAAGTCATGGGGTTGAAGTATCTCATCTTCAATCTCCTCATCCTATTCTTCTTCTTCATCTACGCAAGTGCAGCTGATGAGGCAGAATGTGTGTACGGCATATACGTGCAAACGGGGTCAGTGAAAAAGGCCGGGACTCACTCCAAGATAAGCCTGACCCTATCCGACGCCTCCGGGGCTGAACTCGAGATCGCTAATCTGGAGGATTGGGGTCTGATGGGCCCGGGATTCAACTACTTCGAGACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783781.1
MNPKKVMGLKYLIFNLLILFFFFIYASAADEAECVYGIYVQTGSVKKAGTHSKISLTLSDASGAELEIANLEDWGLMGPGFNYFETGELNIFGGKGPCLSGPICGLNLTSDGSGPYAGWYCEFVQVSAFGLGSPCSYQNFAVEQWLAKDEPPYQLTAAMEVCCASASARARQTLSRRALS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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