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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001889`

染色体: Chr08 坐标: 16395567-16396396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001889`
名称	SmilChr08G001889
描述	uncharacterized SmilChr08G001889
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16395567 - 16396396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001438`
GeneID	`131001438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001438`
原始查询	`SmilChr08G001889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L23/L15e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830147]; symbol=AT4G39880; hit=AT4G39880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L23/L15e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830147]; symbol=AT4G39880; hit=AT4G39880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G39880` (AT4G39880) Ribosomal protein L23/L15e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830147] identity=62.1; qcov=1.02; evalue=8.42e-63; confidence=high
Rice	`Os07g0415200` - identity=48.1; qcov=1.04; evalue=2.75e-45; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0005840 (ribosome); GO:0032543 (mitochondrial translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00276 (Ribosomal_L23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057783820.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783820.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783820.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783820.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783820.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16395897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C11,C69
`Chr8:16395924`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr8:16395924`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr8:16396139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783820.1

179 aa

179

Ribosomal_L23

PF00276 Ribosomal_L23 30-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783820.1`	Pfam	`PF00276`	Ribosomal_L23	Family	30	90	1e-16	61.8	Ribosomal protein L23

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927837.1
AATCCTCTCAACTGAAAAAAAATGGGAAGCAGACTTGGAAAAAGAGTTGTAAACTTCGCGAATCTTCCAATCAAGCTCCTCATGCCCTCATCTTTTTCCAACATTACCGAAATCGCGCTCAAGACAATCCCCTCCGCTTCCAAGATCGAGATAAAGAGGGTTCTGGAATCGTTGTACGGGTTCCAGGTGGAGAAAGTACAGACGCTAAACATGGAGGGGAAGAAGAAGAAATACGGCGGGACAGTGATCGCGAGGCCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001438
ATGGGAAGCAGACTTGGAAAAAGAGTTGTAAACTTCGCGAATCTTCCAATCAAGCTCCTCATGCCCTCATCTTTTTCCAACATTACCGAAATCGCGCTCAAGACAATCCCCTCCGCTTCCAAGATCGAGATAAAGAGGGTTCTGGAATCGTTGTACGGGTTCCAGGTGGAGAAAGTACAGACGCTAAACATGGAGGGGAAGAAGAAGAAATACGGCGGGACAGTGATCGCGAGGCCCGATTACAAGAAGGCTTACGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783820.1
MGSRLGKRVVNFANLPIKLLMPSSFSNITEIALKTIPSASKIEIKRVLESLYGFQVEKVQTLNMEGKKKKYGGTVIARPDYKKAYVTLRSPLSINPELFPIPAVEEARKSKMKQSKSTIVEDPEAVKKSHWLDSAGDKRRYKTPEGRTFGRRGKSVDQKAAAGAQAKFPWSSMTSFGRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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