Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001905`

染色体: Chr08 坐标: 16569466-16572210 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G001905`
名称	SmilChr08G001905
描述	F-box protein FBW2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16569466 - 16572210 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001427`
GeneID	`131001427`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131001427`
原始查询	`SmilChr08G001905`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein FBW2-like
产物	F-box protein FBW2-like
拟南芥	`AT4G08980` (FBW2) F-BOX WITH WD-40 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826476] identity=52.12; qcov=1.0; evalue=1.22e-103; confidence=high
水稻	`Os06g0219700` (OsFbox304) - identity=51.22; qcov=1.0; evalue=3.54e-111; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001427

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	0.80000	`XP_057783806.1`
2	细胞质	0.40000	`XP_057783806.1`
3	细胞质基质	0.20000	`XP_057783806.1`
4	叶绿体	0.20000	`XP_057783806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16571011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:16571482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783806.1

324 aa

162

324

F-box

PF00646 F-box 12-52 aa

XP_057783807.1

324 aa

162

324

F-box

PF00646 F-box 12-52 aa

XP_057783808.1

324 aa

162

324

F-box

PF00646 F-box 12-52 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057783806.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	52	0.00035	21.1	F-box domain
`XP_057783807.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	52	0.00035	21.1	F-box domain
`XP_057783808.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	12	52	0.00035	21.1	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927824.1
ATTCGACTGGACTCGGTTACACCAGAATAGTGAAAGTCCCTTTCATAAAATTTCAAGTTTTTAACCTCGAGAAGGAGAGAGAGAAAGTGAAATAGAGAAAAAGAGAAGAATCTTGATGTATTTTTGCATCAGTAAATACACAACACAAAGACACAAGATACGATATTGCTTTTGCTTCTCTTCTTGTTTTCTTGTGTTGTAGCTTTTCTCACTTTTCCACACTCACACTCACACTCTCTTTCTCTCTCTGTGTAACGACT...

XM_057927825.1
TGCATCAGTAAATACACAACACAAAGACACAAGATACGATATTGCTTTTGCTTCTCTTCTTGTTTTCTTGTGTTGTAGCTTTTCTCACTTTTCCACACTCACACTCACACTCTCTTTCTCTCTCTGTGTAACGACTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGGAGGGGGGAGTGCAAGCTCTAGGACCCTTCATTTCAGGCGGATAAACCGGTGTGTGTTTACAGATCCAAGAGTACTAGAAAAAAGCTTAGATGGAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783806.1_42764
ATGGAGGAGGGTGAGGATTTAAGAAAATGGGATGAATTACTACCTGATGCACTAGGCCTAATATTCAAGAACCTCTCACTATATGATGTTCTAACAGTAGTACCAAGAGTTTGCAAATCGTGGGGGCGAGCAGCTACAGGTCCTTACTGCTGGCAAGAGATCGATATTGAAGAATGGAGTCGAAACAGGAAGCCTGAGGTCGTTGATAGAATGCTCCGATTGCTGATAGCAAGAAGCTGTGGCTCTCTCCGAAAACTCAC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783807.1_42765
ATGGAGGAGGGTGAGGATTTAAGAAAATGGGATGAATTACTACCTGATGCACTAGGCCTAATATTCAAGAACCTCTCACTATATGATGTTCTAACAGTAGTACCAAGAGTTTGCAAATCGTGGGGGCGAGCAGCTACAGGTCCTTACTGCTGGCAAGAGATCGATATTGAAGAATGGAGTCGAAACAGGAAGCCTGAGGTCGTTGATAGAATGCTCCGATTGCTGATAGCAAGAAGCTGTGGCTCTCTCCGAAAACTCAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057783806.1
MEEGEDLRKWDELLPDALGLIFKNLSLYDVLTVVPRVCKSWGRAATGPYCWQEIDIEEWSRNRKPEVVDRMLRLLIARSCGSLRKLTVYGLSLDNTLLFIADHGQSLRSLRLPRCEINDTVVGKAAGMLCGLTFVDLSYCISVGAQGLEALGKNCKSLSSLRWIMHPLEVIEKLSQDDEALAIAATMPKLKNLEIAYLLVETASIIEILSKCKHLELLDVRGCWNVKLDEKFVKMFPKLKVVGPLVVDCYDMNGWDNCSD...

XP_057783807.1
MEEGEDLRKWDELLPDALGLIFKNLSLYDVLTVVPRVCKSWGRAATGPYCWQEIDIEEWSRNRKPEVVDRMLRLLIARSCGSLRKLTVYGLSLDNTLLFIADHGQSLRSLRLPRCEINDTVVGKAAGMLCGLTFVDLSYCISVGAQGLEALGKNCKSLSSLRWIMHPLEVIEKLSQDDEALAIAATMPKLKNLEIAYLLVETASIIEILSKCKHLELLDVRGCWNVKLDEKFVKMFPKLKVVGPLVVDCYDMNGWDNCSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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