Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001910`

染色体: Chr08 坐标: 16622688-16626133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001910`
名称	SmilChr08G001910
描述	uncharacterized SmilChr08G001910
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16622688 - 16626133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001453`
GeneID	`131001453`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001453`
原始查询	`SmilChr08G001910`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836650]; symbol=AT5G65250; hit=AT5G65250; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836650]; symbol=AT5G65250; hit=AT5G65250; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G65250` (AT5G65250) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836650] identity=41.8; qcov=0.921; evalue=7.12e-56; confidence=medium
Rice	`Os08g0484800` - identity=43.9; qcov=0.757; evalue=1.05e-35; confidence=medium
GO	GO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001453

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783827.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057783827.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057783827.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783827.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16623031`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B80
`Chr8:16623031`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B80
`Chr8:16623120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:16623205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:16623235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:16623265`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr8:16623265`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr8:16623268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:16623433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A25,B46,C70
`Chr8:16623501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr8:16625787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B84,C21
`Chr8:16625832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A24,B40,B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927844.1
AAAATAATTTTTTTTAGTTGATCAAATTATTACCCAAATTATTAACACTTGATGATCACAAGATTATTTAGCAATTATCTGCAGCGAGCACAAGAATGCAGAAAGAAATGGGAAAAAAAATAATGTTAGAGGTGGCGCATCCTAATTAAAAATTGCTAATATGCGCGGGTGGGCTGTCTCTCCCGGCGGCAGCCATAGAAAGCATCGCTCCTCTCTCTCAGTGTTGAAAGTCAAAACCATGCAAACGCAATTCTCCTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001453
ATGGCGCTCACACTTTATACCATCTTCACTAACAAGAATCCCACCCCTACACACTCCCTTTTCTCCCCGACACATTTCTCCAAATCCCCCAAATTAACATTCCCGCCCCCAAATTCGAGGACCCATTTCCCCAATCATAGATTTTTCGCGCCCCAACCCAGCCTTCTCGCCGCCGCGAGAATCACCGAGTCATTCCAAGAACCGTACGGAGCCTCGCAGCAGCAAGCTAACGGCAACGGTGGCGCCAATCTCGACACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783827.1
MALTLYTIFTNKNPTPTHSLFSPTHFSKSPKLTFPPPNSRTHFPNHRFFAPQPSLLAAARITESFQEPYGASQQQANGNGGANLDTFLSVLEFVSLASSAAVCFYAAVRCGLQRGGGLGWLGRRVLVWQCVVLVSGLAAGAAIRRRQWRRICGVGLSRVPASPAANLLDRVEKLEEDLRGAATIVQALSRRLEKLGIRFRLTRKALKEPIAETALLVQKNSQATQALAAEGDVLEKELSEIQKVLLSMQEQQQKQLELIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器