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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001911`

染色体: Chr08 坐标: 16627559-16632025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001911`
名称	SmilChr08G001911
描述	protection of telomeres protein 1b
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16627559 - 16632025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001451`
GeneID	`131001451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001451`
原始查询	`SmilChr08G001911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protection of telomeres protein 1b
产物	protection of telomeres protein 1b
Arabidopsis	`AT5G06310` (AtPOT1b) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830519] identity=41.8; qcov=0.996; evalue=5.27e-106; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0000781 (chromosome, telomeric region); GO:0000783 (nuclear telomere cap complex); GO:0010521 (telomerase inhibitor activity); GO:0016233 (telomere capping); GO:0032210 (regulation of telomere maintenance via telomerase); GO:0051974 (GO:0051974); GO:0098505 (G-rich strand telomeric DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02765 (POT1); PF25507 (OB_POT1A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783826.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057783826.1`
3	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057783826.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057783826.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057783826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16629349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:16629351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:16629673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:16631004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:16631157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783826.1

459 aa

230

459

POT1

OB_POT1A

PF02765 POT1 5-142 aa PF25507 OB_POT1A 315-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783826.1`	Pfam	`PF02765`	POT1	Domain	5	142	3.1e-25	89.5	Telomeric single stranded DNA binding POT1/CDC13
`XP_057783826.1`	Pfam	`PF25507`	OB_POT1A	Domain	315	443	7.5e-59	197.8	POT1A-like, OB fold domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927843.1
TAATTTATCCGTGGACGGAGTAAGTAAATGAAATTGAAATTGTAAAATGTGTTGATTATTATTCCAAGTGAAGCTTGATGCAGATTCTGGCGTTTAAAAAGAAGTGCAGATTCTGTTCTTGTATTTTTACGCAGAAATGAAAGATTTCTAAGTAAAGCCAGCAGAAGCAGCTAAATTTAATTTTTGGTGAAAATCAATGACCATTTTACACAGAAAATATAGACTTGCACATTGTATTGTGCTATGGAGACGGGGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001451
ATGAGTGCCGACGGTTACACATTTTTGCAAATACTTGACGCAGTTTCTTGTATTAATCAGCGAGTCAATCTTATCGGTGTAGCAACCGAGACCAGTCTTCCAAAACGTACTAAAGGAACCGATTGTTTTTGCTCGGTAAGGATCATCGATGAATCGCAGCCAAGTGGGATTTATATACATTTTTTTGCTGAAACTATGGAGGAGCTCCCTGCAATTGAGTGTGTTGGAAATATAGTTCTGGTTTCTCATGTTGTGATAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783826.1
MSADGYTFLQILDAVSCINQRVNLIGVATETSLPKRTKGTDCFCSVRIIDESQPSGIYIHFFAETMEELPAIECVGNIVLVSHVVIKTRAEGVYALFNKKFSSFALFEGRGSTIKELVPYQISAKYKPRETDKNAIMRLRKCSFGDKIEALHETLFLREIKEGECFNLLCKILHIAQVKEDEWMLFIWDGTDTPPVSVEAKLEEEKENPLPLALEPSPLSRDILCTFPGVGSVFGMVVDRGREKLGIKFIKSNRWVKFIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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