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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001920`

染色体: Chr08 坐标: 16721615-16725603 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001920`
名称	SmilChr08G001920
描述	uncharacterized SmilChr08G001920
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16721615 - 16725603 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001460`
GeneID	`131001460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001460`
原始查询	`SmilChr08G001920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=24.9; qcov=0.555; evalue=1.87e-21; confidence=weak
Rice	`Os04g0610000` - identity=30; qcov=0.442; evalue=1.37e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF03017 (Transposase_23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783834.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783834.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783834.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783834.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16722132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C2
`Chr8:16722141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B140,C39
`Chr8:16722148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C4,C43
`Chr8:16722246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A10,A19,B10,B107,B110,B113,B117,B118,B123,B124,B126,B136,B138,B21,B29,B31,B4,B53,B54,B58,B60,B62,B74,B86,C25,C27,C30,C36,C40,C44,C5,C51,C58,C6,C62,C63,C65,C67,C84,C9
`Chr8:16722287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:16722641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:16723250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:16723497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B39,C67,C80
`Chr8:16723518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C28,C76,C87
`Chr8:16723518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C76,C87
`Chr8:16723540`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C36,C6
`Chr8:16723540`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C36,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783834.1

550 aa

275

550

Transposase_24

Transposase_23

PF03004 Transposase_24 264-390 aa PF03017 Transposase_23 468-533 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783834.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	264	390	1.2e-21	78.0	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057783834.1`	Pfam	`PF03017`	Transposase_23	Domain	468	533	3.3e-12	46.8	TNP1/EN/SPM transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927851.1
ATTATTAACCATGCATATTCAGCGAACACTTTGAGATTGTGAAGAAAAAGCATCCTCGTTCGAGAAAACATGAAATTGAACGAATCCATGTTAGACAATTTGCATCCTGGTTTGCTGAACGAGTTCAGTCCTTGAATGATGGAGATCCATTTTCATGTGATTTGAAATTATTGGCAAATGGTCCAAATCCTATTGGAAATCAATACAAGAAAATTTTGGTGAATGGTTTCAGATTTCATACAAAAGAAGTGGAATCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001460
ATGGCTCTGAGGACTCGGAGATCAAAACTGTGCAGAAAGTCGAATTATGAATTACAAGATGAGGAGATCGAGATTTATGAGCAACAAATCAAACAAGCAGCTATTGATCAGCAAGTTGCCAATAAAATAAAGGAGCATGGACAGCAGGATAGTGTTATGAAATCACAACCAAAAATTAGTCAAGTAGCTCGGGGACAACAGGCTATTGGGGGTCAAGATATGACTTTGAGGACTCGAAAATCAATTGCACAAAGAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783834.1
MALRTRRSKLCRKSNYELQDEEIEIYEQQIKQAAIDQQVANKIKEHGQQDSVMKSQPKISQVARGQQAIGGQDMTLRTRKSIAQRKLNHRLQDEDVSHRLQDEEEIQEYEQQSTNQTEENEQQLQPEFSEGQGSSKKSRGPTYLPNLWARNSNEGRILVNFNKRGQPIGPNKKIFTGFLGTLARNSRFTPLDIEDWRKMPKIRKDELLRMVKERFEVPKDADHWILLSIGKKRRHWKSRVKGGSFVPTLAIENQAHNRPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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