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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001921`

染色体: Chr08 坐标: 16724778-16728280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001921`
名称	SmilChr08G001921
描述	uncharacterized SmilChr08G001921
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	16724778 - 16728280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998130`
GeneID	`130998130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998130`
原始查询	`SmilChr08G001921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=40.9; qcov=0.783; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779547.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779547.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779547.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779547.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:16724800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B87
`Chr8:16724806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr8:16724860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B54,C75
`Chr8:16724871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:16724925`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A11,B101,B107,B108,B112,B114,B126,B138,B140,B22,B28,B31,B37,B40,B45,B57,B69,B73,B75,B76,B77,C1,C10,C21,C27,C4,C41,C62,D10,D4
`Chr8:16724950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C3
`Chr8:16724961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B64
`Chr8:16724963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:16725011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C3
`Chr8:16725126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C49
`Chr8:16725204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:16725254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B129,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779547.1

1072 aa

536

1072

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 3-77 aa PF02992 Transposase_21 290-499 aa PF13960 DUF4218 683-779 aa PF13952 DUF4216 951-1019 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779547.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	77	1e-19	71.2	Transposase-associated domain
`XP_057779547.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	290	499	1.4e-97	325.7	Transposase family tnp2
`XP_057779547.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	683	779	3.2e-33	114.7	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057779547.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	951	1019	5.5e-20	72.4	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923564.1
ATGGATAAGACTTGGATGAAATTTCCTAGGAATAGCAAAACGTATTTGGATGGACTGAAAATGTTCCTTGATTTTGCTTTCTCCAAAGAAAACACAAGTGTTAATGGAATGATATTGTGCCCCTGTAAGACATGTAAAAATGGGATTTGCCTACCAAGGGAAGATGTAGAAGTTCATTTAAGGTGTTTAGGATTTATTAGGGGCTACACTCAATGGATAGCTCAAGGTGAAACCTCTAATTTTACAACTCCCAATTCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998130
ATGGATAAGACTTGGATGAAATTTCCTAGGAATAGCAAAACGTATTTGGATGGACTGAAAATGTTCCTTGATTTTGCTTTCTCCAAAGAAAACACAAGTGTTAATGGAATGATATTGTGCCCCTGTAAGACATGTAAAAATGGGATTTGCCTACCAAGGGAAGATGTAGAAGTTCATTTAAGGTGTTTAGGATTTATTAGGGGCTACACTCAATGGATAGCTCAAGGTGAAACCTCTAATTTTACAACTCCCAATTCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779547.1
MDKTWMKFPRNSKTYLDGLKMFLDFAFSKENTSVNGMILCPCKTCKNGICLPREDVEVHLRCLGFIRGYTQWIAQGETSNFTTPNSFFNEPSDGDNMQEMLNDAFGVPYDDVEIGENEADEIEEPNSEAKSFYKLVDDSQQELWPGCKKFSKLSFLVRLYHIKCLGKISNKAFTMLLELLNEAFPEGVKLPKSNYAARRVIEELGLGYKKYDACPNDCTLFWGKDKNSIQCETCSSTRWVVSDGDPTGEKRKVPHKVLWH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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