当前解析结果
SmilChr08G001958| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001958 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001958 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001958 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 17245213 - 17246752 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998136 |
|---|---|
| GeneID | 130998136 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998136 |
| 原始查询 | SmilChr08G001958 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=38.9; qcov=0.361; evalue=1.41e-29; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998136 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779553.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057779553.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779553.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779553.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779553.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:17245225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr8:17245229 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B78,B94 |
Chr8:17245243 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B78,B94 |
Chr8:17245245 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B69,B82,C52 |
Chr8:17245283 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B36,B75,B82,B95 |
Chr8:17245348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B4,B89,C23 |
Chr8:17245353 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B96 |
Chr8:17245353 |
TGC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr8:17245357 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B96 |
Chr8:17245357 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr8:17245478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr8:17245677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。