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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001965`

染色体: Chr08 坐标: 17345063-17345572 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001965`
名称	SmilChr08G001965
描述	uncharacterized SmilChr08G001965
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17345063 - 17345572 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998137`
GeneID	`130998137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998137`
原始查询	`SmilChr08G001965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=33.1; qcov=0.858; evalue=4.61e-24; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=20; qcov=0.917; evalue=4.42e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779554.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779554.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057779554.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779554.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17345078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr8:17345085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:17345092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A13,A21,B108,B110,B137,B20,B54,B57,B67,B83,B86,B9,C18,C5,C56,C57,C6,C70,C76
`Chr8:17345093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B24,B53,C25,D5
`Chr8:17345117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B2,B37
`Chr8:17345132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B2,B37
`Chr8:17345147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B37,D11
`Chr8:17345154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr8:17345174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:17345182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B99,C87
`Chr8:17345188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B6
`Chr8:17345188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779554.1

169 aa

169

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 102-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779554.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	102	148	1.4e-06	28.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923571.1
ATGGGAAAAGGATTTTTCACGCTGAAGTTCGGAACACAACAAGACAAAGACATAGCCAAGGCCAAAACGGTTTGGGATCTTTCTTCTGGCTCACTTCGATTGCGTGAATGGACTCGCAACTTTGATCCTCATAAGGAAATATCTTCCCTTAGTCAAGTTTGGGTTCGCATATATAATATGCCCGCTGAATATTGGCACCCAGAGGTTTTTGCGGCCATTGGACGTACGTTAGGATTTCCTATCAAATTGGATGGCACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998137
ATGGGAAAAGGATTTTTCACGCTGAAGTTCGGAACACAACAAGACAAAGACATAGCCAAGGCCAAAACGGTTTGGGATCTTTCTTCTGGCTCACTTCGATTGCGTGAATGGACTCGCAACTTTGATCCTCATAAGGAAATATCTTCCCTTAGTCAAGTTTGGGTTCGCATATATAATATGCCCGCTGAATATTGGCACCCAGAGGTTTTTGCGGCCATTGGACGTACGTTAGGATTTCCTATCAAATTGGATGGCACTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779554.1
MGKGFFTLKFGTQQDKDIAKAKTVWDLSSGSLRLREWTRNFDPHKEISSLSQVWVRIYNMPAEYWHPEVFAAIGRTLGFPIKLDGTSANWEVGSFARLLVEIDLSLPLIDSMTIDCDITSFYVEFVYEQLPRYCSLCNITGHVLDKCKRLKINADGNDSKQAPAKEGNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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