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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001976`

染色体: Chr08 坐标: 17443871-17449010 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001976`
名称	SmilChr08G001976
描述	putative U-box domain-containing protein 50
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17443871 - 17449010 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001511`
GeneID	`131001511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001511`
原始查询	`SmilChr08G001976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative U-box domain-containing protein 50
产物	putative U-box domain-containing protein 50
Arabidopsis	`AT5G65500` (AT5G65500) U-box domain-containing protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836676] identity=42.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os10g0100500` (OsPUB61) - identity=27.6; qcov=1.08; evalue=1.25e-70; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF04564 (U-box); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783889.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783889.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783889.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783889.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17446066`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B119,B120,B15,B63,B77,B81,C1,C26,C35,C37,C56,C62,C65,D7
`Chr8:17446315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:17446491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:17446645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:17446656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D10
`Chr8:17446790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B99
`Chr8:17446825`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B17,B99
`Chr8:17446825`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B17,B99
`Chr8:17446873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B56
`Chr8:17446913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B85,D11,D7
`Chr8:17447082`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr8:17447082`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783889.1

763 aa

382

763

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

U-box

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 430-559 aa PF00069 Pkinase 436-559 aa PF04564 U-box 682-749 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783889.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	430	559	2.5e-18	67.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057783889.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	436	559	1.8e-12	47.9	Protein kinase domain
`XP_057783889.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	682	749	1.5e-14	54.6	U-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927906.1
CGTTTATTTCCACACACACAGATATGGAGAAAGTGTGCGTTGCGATAGGAACGGAGGGGTTGGAGGGGTTTTCGACGTTGCAGTGGGCGCTGCGGAGATGGAGCAATCATAGAATTCTGATTCTTCATGCACCAAACGCCGCCTCCAAACACTACGTCTACACGCCACTTGGGAAGCTTCGGAGCAGCTCGGTCAGCGAGGAGAAGCTCAAGCTTCTCGACAAAACCGACCAAGCCAATGCAGACAGAGTCCTTGCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001511
ATGGAGAAAGTGTGCGTTGCGATAGGAACGGAGGGGTTGGAGGGGTTTTCGACGTTGCAGTGGGCGCTGCGGAGATGGAGCAATCATAGAATTCTGATTCTTCATGCACCAAACGCCGCCTCCAAACACTACGTCTACACGCCACTTGGGAAGCTTCGGAGCAGCTCGGTCAGCGAGGAGAAGCTCAAGCTTCTCGACAAAACCGACCAAGCCAATGCAGACAGAGTCCTTGCTCAATACATAGCCTTCTGTGGCAGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783889.1
MEKVCVAIGTEGLEGFSTLQWALRRWSNHRILILHAPNAASKHYVYTPLGKLRSSSVSEEKLKLLDKTDQANADRVLAQYIAFCGRVEAQVMKMEIKEEEPLHKQIVEAISNLGISKLVMSLAFMKPSSSPKSRGAISGTFYVVRNKPSFCELFVICQGQRIFLRDDGFMEDDKGRNHSVKNWLGRMFPETSPTNHWDKCRDDIEHYAHQLLSLHQLEGDMEACNSTDLCIPQNMDGAERIEVLKRTIRDAQGTIQLNRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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