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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001989`

染色体: Chr08 坐标: 17607407-17609963 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001989`
名称	SmilChr08G001989
描述	uncharacterized SmilChr08G001989
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17607407 - 17609963 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001521`
GeneID	`131001521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001521`
原始查询	`SmilChr08G001989`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829958]; symbol=AT4G38020; hit=AT4G38020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829958]; symbol=AT4G38020; hit=AT4G38020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G38020` (AT4G38020) tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829958] identity=63.01; qcov=0.819; evalue=9.65e-127; confidence=high
Rice	`Os03g0685100` - identity=53.71; qcov=0.808; evalue=1.72e-97; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0006396 (RNA processing); GO:0008173 (RNA methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00588 (SpoU_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001521

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，投票比例不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057783904.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057783904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17607597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B26,B51,C35,C77
`Chr8:17607612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:17607670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B26,B51,C35,C77
`Chr8:17608234`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A4,B130,B17,B52,C57,C70,C81,C86,D4
`Chr8:17608308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:17609481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B51,C35
`Chr8:17609548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,D11,D7
`Chr8:17609586`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr8:17609586`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr8:17609693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783904.1

349 aa

174

349

SpoU_methylase

PF00588 SpoU_methylase 193-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783904.1`	Pfam	`PF00588`	SpoU_methylase	Family	193	340	7e-31	107.9	SpoU rRNA Methylase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927921.1
CATGATCATTTGAAATTGAGGGCAAAATTGAAAAACAGTTGGGGGTCTAAATGCAAAAGCGTAACACTTCAGGGGGCTTATTACAAAGTACAAAGAGTCCAATGAAAACCAACGTTTTGAGATAACTCAAAAAGCTTGCTTCCCAACAAACAGAAGGCGAGAACGAAAGTACAACACCAAGAATGCAATGTCCGAACAAATTCTTCATCTCACCTTCTCTTTCTCTCACTAGCTCACCGAATCCGCAGACCAAGAATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783904.1_42849
ATGCAATGTCCGAACAAATTCTTCATCTCACCTTCTCTTTCTCTCACTAGCTCACCGAATCCGCAGACCAAGAATCCAGCTTTTCAGACCCGCTGTACAGGTAGAACCCACAAAATCCATGAGAGCACTTGCGACGGAAGTGTTCGTGAAATTGCCTCAAAGAAGGCGTTTTGTTTACCTCCAAATGTGAAAACCATTACAAGCACGTCGAACCTATTTGTTAAACATTGTGTGAAGCTTCGACAGAGTTCCTCGTATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783904.1
MQCPNKFFISPSLSLTSSPNPQTKNPAFQTRCTGRTHKIHESTCDGSVREIASKKAFCLPPNVKTITSTSNLFVKHCVKLRQSSSYRHLHGMVLVVGITPVREIYSSHMSESARPIIECLFVVGNCSLPEEMDSKAVHVVEVSSEVMKKISGIQSVDSVEVIALMRIPSTFRVVNDSLHDEDFQTLFSFPHRILVLDGIQDPGNLGTLVRSATAFRWDGVFLLPGCCDPFNDKALRACRGACFQIPIVSGSWEHIGALRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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