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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002007`

染色体: Chr08 坐标: 17849491-17849949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002007`
名称	SmilChr08G002007
描述	uncharacterized SmilChr08G002007
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17849491 - 17849949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998146`
GeneID	`130998146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998146`
原始查询	`SmilChr08G002007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.2; qcov=0.408; evalue=1.02e-12; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=56.5; qcov=0.967; evalue=9.29e-55; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779561.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779561.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057779561.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17849530`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A10,A16,A18,A19,A8,B10,B102,B106,B118,B12,B123,B125,B130,B131,B15,B17,B28,B32,B34,B42,B43,B51,B53,B74,B79,B8,B83,B84,C11,C13,C15,C22,C24,C28,C3,C32,C34,C39,C44,C46,C52,C53,C55,C58,C60,C68,C69,C71,C73,C87
`Chr8:17849536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:17849554`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr8:17849554`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr8:17849576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B107,B122,B125,B130,B23,B76,B99,C21,C30,C36,C75,D3
`Chr8:17849591`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	67	A10,A21,A22,A23,A24,A7,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B109,B11,B110,B115,B119,B122,B135,B138,B14,B16,B18,B22,B23,B3,B40,B44,B45,B47,B48,B49,B55,B59,B6,B60,B64,B66,B8,B81,B82,B85,B87,B88,B98,C18,C20,C27,C28,C31,C33,C40,C44,C45,C46,C48,C52,C53,C60,C67,C7,C80,C81,D10,D11,D2,D6
`Chr8:17849602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B130,C30,C50,C75
`Chr8:17849602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C30,C50,C75
`Chr8:17849607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:17849608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:17849615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C5,C50
`Chr8:17849616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779561.1

152 aa

152

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 5-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779561.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	5	152	1.7e-60	204.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923578.1
ATGCATGAGGCCAAACATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCACTGGGCTTGGAAGAATTATCTAGTGGCTTGGCATGACGCTTACACTCGAGAGGATCAGGGCGAGTCCACGATTATATTAGAGGTTGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATATGGCACGCCATCTTCGGAGTCGCTAGCTCAAATAACGACATCAACGTTCTCAACCAGTCCATGTTATTCAATGACGTCCTATCGGACAATGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998146
ATGCATGAGGCCAAACATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCACTGGGCTTGGAAGAATTATCTAGTGGCTTGGCATGACGCTTACACTCGAGAGGATCAGGGCGAGTCCACGATTATATTAGAGGTTGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATATGGCACGCCATCTTCGGAGTCGCTAGCTCAAATAACGACATCAACGTTCTCAACCAGTCCATGTTATTCAATGACGTCCTATCGGACAATGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779561.1
MHEAKHGFPGMLGSLDCMHWAWKNYLVAWHDAYTREDQGESTIILEVVASQDLWIWHAIFGVASSNNDINVLNQSMLFNDVLSDNEAAVHFIANNFHHTRGYYLTDGIYPDWPVFIKSFTFSSNEKKRRFKLMQKAAMKDVERAFGVLQARW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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