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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002020`

染色体: Chr08 坐标: 17985635-17987340 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002020`
名称	SmilChr08G002020
描述	plasmodesmata-located protein 7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	17985635 - 17987340 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001649`
GeneID	`131001649`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001649`
原始查询	`SmilChr08G002020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasmodesmata-located protein 7-like
产物	plasmodesmata-located protein 7-like
Arabidopsis	`AT5G37660` (PDLP7) plasmodesmata-located protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833744] identity=60.9; qcov=0.983; evalue=8.81e-114; confidence=high
Rice	`Os04g0537800` - identity=42.8; qcov=0.948; evalue=8.11e-70; confidence=medium
GO	GO:0009506 (plasmodesma)
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001649

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057784188.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784188.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784188.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784188.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:17986246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:17986535`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr8:17986535`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr8:17986689`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr8:17986689`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr8:17986775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:17986788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C14
`Chr8:17986887`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B96,C71
`Chr8:17986887`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B96,C71
`Chr8:17986967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:17987074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:17987098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784188.1

286 aa

143

286

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 38-132 aa PF01657 Stress-antifung 179-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784188.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	38	132	1.3e-31	109.8	Salt stress response/antifungal
`XP_057784188.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	179	233	1.3e-31	109.8	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928205.1
TATTTAAATATTTGTTATAAATTAAAATAACGGTTTGAAGACTTTTCCACGTCATCACCACGGTTATAAAACAATTTAATCCCAAAACACAATCCCCGGCCTACTTAAACACTCATATCTCCATGCAAAACCATCTTGACTTCACTTCTCCGAAACATGGAAACAGCTCCTTCTTCTAATCTCCTTATTACTGTCTCTGTCCAAATCTTGAGCATTTTGTTCTTCATTCCGGCCTCCTCCGCGGCCGACTCCTTCATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001649
ATGGAAACAGCTCCTTCTTCTAATCTCCTTATTACTGTCTCTGTCCAAATCTTGAGCATTTTGTTCTTCATTCCGGCCTCCTCCGCGGCCGACTCCTTCATCTACGGCGGGTGCTCGCAGGTGAAATACACGGCGGGGTCCCAATACGAATCAAATCTCAACTCCCTGCTGACCTCTCTGGTGAACTCGGCCACCTACTCAGCCTACAACAAGTTCACCATCATGGGGTCCACCCCGCAAGACGTGGTCTACGGGCTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784188.1
METAPSSNLLITVSVQILSILFFIPASSAADSFIYGGCSQVKYTAGSQYESNLNSLLTSLVNSATYSAYNKFTIMGSTPQDVVYGLYQCRADLAMPECATCVARAVSHLAPLCPQACGAAIQLDACFAKYDNVSFIGVEDKAVVMNKCGPSDGFDADRMARRDAMLAGLSRPGGPFRVGGSEDVQGVAQCVGDLSNGQCQDCLTEAMRRLKAECGGAVFGDMFLAKCYARYSTNGAHAYSQPNHVHSTSHSDSEKTFAIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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