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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002034`

染色体: Chr08 坐标: 18118717-18122626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002034`
名称	SmilChr08G002034
描述	receptor protein kinase TMK1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18118717 - 18122626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001533`
GeneID	`131001533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001533`
原始查询	`SmilChr08G002034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor protein kinase TMK1
产物	receptor protein kinase TMK1
Arabidopsis	`AT1G66150` (TMK1) transmembrane kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842930] identity=72.5; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0717000` (OsTMK) - identity=63; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783920.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783920.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783920.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783920.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18119308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B72,C11,C69
`Chr8:18119343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:18119512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B70,C52,C61,D10
`Chr8:18119547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:18119615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B63,B65,B82,C8
`Chr8:18120176`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr8:18120176`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr8:18120181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C39
`Chr8:18120254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:18120490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B80,C48
`Chr8:18120551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C52,D3
`Chr8:18120672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783920.1

946 aa

473

946

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

LRRNT_2

LRR_8

LRR_4

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 34-69 aa PF13855 LRR_8 115-154 aa PF00560 LRR_1 120-140 aa PF00560 LRR_1 264-286 aa PF08263 LRRNT_2 333-368 aa PF13855 LRR_8 389-430 aa PF12799 LRR_4 394-430 aa PF00560 LRR_1 395-417 aa PF00069 Pkinase 594-866 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 596-821 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	34	69	3.4e-15	56.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	115	154	5.3e-24	84.5	Leucine rich repeat
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	120	140	9.7e-18	61.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	264	286	9.7e-18	61.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	333	368	3.4e-15	56.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	389	430	5.3e-24	84.5	Leucine rich repeat
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	394	430	5.6e-21	74.8	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	395	417	9.7e-18	61.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	594	866	6.8e-45	154.2	Protein kinase domain
`XP_057783920.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	596	821	2.4e-45	155.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927937.1
CTTTCCCTCTTAATTAGTAGTAACTTGAATCACCATAGAAAAAAAGAAAGTATTGATTTGATTTATAGTAGTACATGGAGACAGCTTAGCTTGTTTTCTCTGTGGAAAGGGGAGCAGAGTGTTTGGGTTCGGCCCATGTTCCAAAGAATCATCCACTTATTATACAGCTTTTAAACACTGTCATCTTTATTCACAAAATTATCTGCTATTGTGGGGACACCTCTGCATGTGCTCCAGCTCCTTTCTCTATGCTATTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001533
ATGAAGCCCAGTTCAGGGCTAAAGATTCAGTCTTTGGAATCTCTCTTACATGGGTTGCTGCTGTTATCCGCATTTCTGTCTGTGAAATCACAGACCAGCTCAGACGATGCTGCCGCCATGCTTGCGCTCAAGAAAAGCCTAAACCCACCACCGGATCAGCTCTCTTGGTCCGACCCGGATCCGTGTAAGTGGGACCGGGTCGTCTGCGTCCAGAACCGGGTGAAACGGATTCAAATCGGCCACCAAAATCTTGCAGGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783920.1
MKPSSGLKIQSLESLLHGLLLLSAFLSVKSQTSSDDAAAMLALKKSLNPPPDQLSWSDPDPCKWDRVVCVQNRVKRIQIGHQNLAGTLPQQLSALAELERLELQWNNISGPLPTLKGLNSLQVLMLSNNHFTSIPADFFEGMSSLLSLEIDNNPFSAWEIPDSLRNASTLTNFSANSANISGKIPSFFGPDAFPGLINLHLALNNLEGELPASFSGSQIESLWLNGQKLSGGIDAMQNMTFLKEVWLHGNGFLGPLPEFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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