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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002066`

染色体: Chr08 坐标: 18537903-18540785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002066`
名称	SmilChr08G002066
描述	uncharacterized SmilChr08G002066
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18537903 - 18540785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998153`
GeneID	`130998153`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998153`
原始查询	`SmilChr08G002066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]; symbol=MUG3; hit=AT1G06740; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22.6; qcov=0.378; evalue=1.85e-07; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=25.5; qcov=0.239; evalue=5.15e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998153

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779569.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779569.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779569.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779569.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18537905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B33
`Chr8:18538129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B21
`Chr8:18538159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C18,C85
`Chr8:18538162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:18538166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B31
`Chr8:18538190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:18538201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B90,C33,C53
`Chr8:18538206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B67,B7,C33,C9
`Chr8:18538229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B43,B60,B62,B75,D3
`Chr8:18538243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B54,C49,C57
`Chr8:18538271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B62,C18,C75
`Chr8:18538280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B90,C33,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779569.1

444 aa

222

444

PB1-like

PF26130 PB1-like 5-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779569.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	5	100	4.5e-14	53.3	PB1-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923586.1
ATGGGAGATAGTGACTCATTTGGCTTGTATATTCACCATGGTGGGAAGTTTGTCCACTTAGGTGCAAGTAGATTGTACTCAGGTGGTGACGTTTTGGGGAAATTCGGTTTAGATAAGGATAGGTTTGGTTATTTTGACTTAGAGGAGGAAATCAAGCAGCTTGGGTATACTTCTTGGAGGTGTTTAGCTTTCAAGGTTCCTAGAACTTTAGTGTTTATGGATTTGTGTGATGATAAGCAGGTAATGCAAATGATACAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998153
ATGGGAGATAGTGACTCATTTGGCTTGTATATTCACCATGGTGGGAAGTTTGTCCACTTAGGTGCAAGTAGATTGTACTCAGGTGGTGACGTTTTGGGGAAATTCGGTTTAGATAAGGATAGGTTTGGTTATTTTGACTTAGAGGAGGAAATCAAGCAGCTTGGGTATACTTCTTGGAGGTGTTTAGCTTTCAAGGTTCCTAGAACTTTAGTGTTTATGGATTTGTGTGATGATAAGCAGGTAATGCAAATGATACAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779569.1
MGDSDSFGLYIHHGGKFVHLGASRLYSGGDVLGKFGLDKDRFGYFDLEEEIKQLGYTSWRCLAFKVPRTLVFMDLCDDKQVMQMIQCCTSTITCVSIYVDDGKKGKVKKAVTESETVTKTVAKTITTTKSSSNKGKGKGKVNQSKGKEKVFDREEPASVVKKQNVQIELRKGKDTDRVVKEQNVHIEPKTEHDVLMEELHETDEDDDDYVPQFSETEDVESDDSLGDKELGSEDEEYMQARSNVRESIGVIAEMGLEKEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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