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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002071`

染色体: Chr08 坐标: 18567050-18569091 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002071`
名称	SmilChr08G002071
描述	uncharacterized SmilChr08G002071
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18567050 - 18569091 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998154`
GeneID	`130998154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998154`
原始查询	`SmilChr08G002071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22; qcov=1.03; evalue=3.08e-27; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=24.5; qcov=0.847; evalue=6.16e-33; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779570.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779570.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779570.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779570.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18567056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A16,B102,B104,B119,B14,B34,B37,B71,B81,B90,C39,C80,C9,D10
`Chr8:18567062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:18567068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:18567083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:18567161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18567184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B30,C68
`Chr8:18567201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18567202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B30,D10
`Chr8:18567214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18567264`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B100,B60,B7,C21,C45,C60,C7
`Chr8:18567266`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A10,A20,A25,A7,B102,B11,B135,B22,B26,B40,B44,B97,C26,C30,C33,C70,C77,D1,D3
`Chr8:18567291`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	38	A22,A4,B109,B120,B122,B133,B137,B140,B15,B18,B25,B26,B37,B46,B58,B63,B68,B74,B86,B90,B91,B92,B94,C15,C2,C28,C37,C41,C51,C52,C57,C63,C65,C72,C73,C75,C85,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779570.1

535 aa

268

535

SWIM

PF04434 SWIM 502-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779570.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	502	524	9e-05	22.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923587.1
ATGGAACAAGCTGTGACGGATCTTGGTTTTGTGCATTTATTAAATGCTCAAAATATTGCATCGCAATTGTATGCAAATGTGATGCCTCATGTTGCTCACAATGTCAATGTGGCACAAGGTTATATTCTGAGTGACATTGTGAATATAGAGCCGGAGGATGAAAGGAGTAATGTATTGATTTATGACAATGATGATGTTGCTGAAGATGATGTTGCGGACGATGTGGATACTGATTATCATGTCAGGGACGATGTGGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998154
ATGGAACAAGCTGTGACGGATCTTGGTTTTGTGCATTTATTAAATGCTCAAAATATTGCATCGCAATTGTATGCAAATGTGATGCCTCATGTTGCTCACAATGTCAATGTGGCACAAGGTTATATTCTGAGTGACATTGTGAATATAGAGCCGGAGGATGAAAGGAGTAATGTATTGATTTATGACAATGATGATGTTGCTGAAGATGATGTTGCGGACGATGTGGATACTGATTATCATGTCAGGGACGATGTGGATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779570.1
MEQAVTDLGFVHLLNAQNIASQLYANVMPHVAHNVNVAQGYILSDIVNIEPEDERSNVLIYDNDDVAEDDVADDVDTDYHVRDDVDTDYDDGDDVDSLDEDNDYVVEDVVHPMSNRHTVQPLESGTDLYRREALSSGCTYADKEKLQISLGLYHLQNRIDYVVERSNKTRFSVVYMNKEKYAFLMRATSVETGSVWRVSKWNAPHTCEMDLRNHGRRTVGAKVIDAFFAPTLLNEWAILRPNEMLAQLQRQFGIQVDYKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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