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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002073`

染色体: Chr08 坐标: 18638792-18639779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002073`
名称	SmilChr08G002073
描述	histone H1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18638792 - 18639779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001682`
GeneID	`131001682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001682`
原始查询	`SmilChr08G002073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H1
产物	histone H1
Arabidopsis	`AT2G18050` (HIS1-3) histone H1-3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816317] identity=75.3; qcov=0.385; evalue=2.9e-36; confidence=low
Rice	`Os04g0253000` (H1) - identity=60; qcov=0.525; evalue=6.87e-36; confidence=medium
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030261 (chromosome condensation); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0031492 (nucleosomal DNA binding); GO:0045910 (negative regulation of DNA recombination)
KEGG	-
Pfam	PF00538 (Linker_histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784233.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057784233.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057784233.1`
4	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057784233.1`
5	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.40000	`XP_057784233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18638939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:18639024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D11
`Chr8:18639298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B33
`Chr8:18639304`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B58,C72,D9
`Chr8:18639304`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B58,C72,D9
`Chr8:18639368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,B60,B85,B87,C67
`Chr8:18639427`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr8:18639427`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr8:18639482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:18639619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,C51,C57,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784233.1

200 aa

100

200

Linker_histone

PF00538 Linker_histone 42-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784233.1`	Pfam	`PF00538`	Linker_histone	Domain	42	108	3.7e-17	63.0	linker histone H1 and H5 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928250.1
GCAACCGACCTCACAAGGATCGTGCTCCGCTATATAAAGCGTAAACAACTCTACGTAGTTCACACAATCAAATCAATATCATAACTTCCGTATTTACTCTCTCAATCACAGTTATCTACGTGTTGAAAGTTGTCTTATAGTGATGACGGCGGCCGAAGTAGTTAAGAAGCCAGCGGCGGCGAAGCCCGTCAAGGAGAAGAAAGCAGCCAAGGCGGCGCCCAAGGAGAAGAAGGCCAAGACTGAAAAATCAGCTAAAACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001682
ATGACGGCGGCCGAAGTAGTTAAGAAGCCAGCGGCGGCGAAGCCCGTCAAGGAGAAGAAAGCAGCCAAGGCGGCGCCCAAGGAGAAGAAGGCCAAGACTGAAAAATCAGCTAAAACCGCTTCGCATCCGCCTTACTTTGAGATGATCAAGGAGGCGTTGTCGGCGTTGAACGAGAAGAGCGGTTCGAGCCCTTACGCGATTGCGAAGTACATGGAGGAGAAACACAAGTCGGTGCTGCCGGCGAATTTCAGGAAGATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784233.1
MTAAEVVKKPAAAKPVKEKKAAKAAPKEKKAKTEKSAKTASHPPYFEMIKEALSALNEKSGSSPYAIAKYMEEKHKSVLPANFRKILGLQLKNSAAKGKLNKIKASYKLSDAGKKEKAAAAKKPAVAAAKKPRAAKAAAPTAAAGTKRKAEAVKKVAVKKGAKKVAVKKGAKKVATPVKAKQPKSIKSPAAKRARRAVAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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