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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002075`

染色体: Chr08 坐标: 18657807-18667040 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002075`
名称	SmilChr08G002075
描述	glutamate decarboxylase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18657807 - 18667040 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001581`
GeneID	`131001581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001581`
原始查询	`SmilChr08G002075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate decarboxylase 1
产物	glutamate decarboxylase 1
Arabidopsis	`AT5G17330` (GAD) glutamate decarboxylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831599] identity=84.46; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os03g0720300` (GDCi) - identity=83.6; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0004351 (glutamate decarboxylase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006538 (L-glutamate catabolic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00430 (Taurine and hypotaurine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00650 (Butanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00282 (Pyridoxal_deC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001581

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784046.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057784046.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057784046.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18658429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B35,C61
`Chr8:18665585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C52
`Chr8:18665628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A14,A25,B21,C5
`Chr8:18665681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18665762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:18666089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:18666609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B110,C20,C73
`Chr8:18666613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:18666621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B33
`Chr8:18666624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C8
`Chr8:18666724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784046.1

494 aa

247

494

Pyridoxal_deC

PF00282 Pyridoxal_deC 39-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784046.1`	Pfam	`PF00282`	Pyridoxal_deC	Domain	39	381	1.4e-106	357.1	Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928063.1
ACCTCCTTTTGAATTATTCGACAAGATAATATATTATTGACCCTTTTCTATGATCAACAATGACGCTCAACAAAAAAATGAGTGGATTCAAGATATTTTTATGAAAGTGGGTACTTTTAACATGTTACTTATCAAAGTTGGGTAATTATAATTTTCACCTGAATTAATTTTAATTTTATTTTACCAATACACATACTATAATCAATTTATACGTACATACGGCTGAAATTAAAACATCACAGATGCAGAAGAGCTGCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001581
ATGGTTCTCTCAAAGACCGCCTCTGAATCCGACGTCTCAGTCCACTCGACTTTTGGTTCGCGTTATGTTCGCCACTCTCTCCCCAGGTTTAAGATGTCGGAAGAATCGATCCCGAAGGAAGCGGCGTACCAGATCATCAACGACGAGCTGATGCTCGACGGAAATCCGAGGCTGAATCTGGCCTCCTTCGTCACCACGTGGATGGAGCCAGAGTGCGACAAGCTAGTTATGGCCTCCATTAACAAAAACTACGTCGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784046.1
MVLSKTASESDVSVHSTFGSRYVRHSLPRFKMSEESIPKEAAYQIINDELMLDGNPRLNLASFVTTWMEPECDKLVMASINKNYVDMDEYPVTTELQNRCVNMIAHLFNAPLGDDETAVGVGTVGSSEAIMLAGLAFKRKWQNKMKALGKPHDKPNIVTGANVQVCWEKFARYFEVELKEVKLREGYYVMDPEKAVELVDENTICVAAILGSTLNGEFEDVKRLNDLLIEKNKQTGWDTPIHVDAASGGFIAPFLYPELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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