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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002077`

染色体: Chr08 坐标: 18672732-18677749 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002077`
名称	SmilChr08G002077
描述	transmembrane 9 superfamily member 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18672732 - 18677749 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001559`
GeneID	`131001559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001559`
原始查询	`SmilChr08G002077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 3
产物	transmembrane 9 superfamily member 3
Arabidopsis	`AT2G01970` (AT2G01970) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814728] identity=87.2; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0237000` (OJ1081D05.4) - identity=85.3; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057784006.1`
2	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057784006.1`
3	Endosome	内体	0.60000	`XP_057784006.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.60000	`XP_057784006.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057784006.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18673044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B109,B6,B60,B63,B65,B75,B82,B85,B86,B87,B91,C31,C67,C7,C8,C81
`Chr8:18673928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:18674618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:18674678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:18675882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:18676310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18677321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784006.1

594 aa

297

594

EMP70

PF02990 EMP70 55-551 aa

XP_057784007.1

594 aa

297

594

EMP70

PF02990 EMP70 55-551 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784006.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	55	551	2.2e-180	601.4	Endomembrane protein 70
`XP_057784007.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	55	551	2.2e-180	601.4	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928024.1
GCGGTAGAAAAAGATAGGCAGTCATAATCTGCTGCCTAAATCCGTTATAAAGTCTCAATTGCATGTCAACTGTCACCTGCTCCAACCGCGCGTCTCCTTTCTCATTCTTTCCTTCATTTTTCATTTTCATTTTCATCTACTTTTACTATATTAGATCCAGATCTGACCTTCTCTCTCATACCAATCCCCCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCAGTGATATATCACAGTGAGAGGATTCTACACCCATTCACTCAGTTGAG...

XM_057928023.1
TGCCTAAATCCGTTATAAAGTCTCAATTGCATGTCAACTGTCACCTGCTCCAACCGCGCGTCTCCTTTCTCATTCTTTCCTTCATTTTTCATTTTCATTTTCATCTACTTTTACTATATTAGATCCAGATCTGACCTTCTCTCTCATACCAATCCCCCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTTCCAGTGATATATCACAGTGAGAGGATTCTACACCCATTCACTCAGTTGAGTGTGCGGTGTGCGAAGAAAAAGGCATGGCCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001559
ATGGCCAGACGAGGTGGAGGAGGAGGCTGGCACGTCATCTTTTTTCTGCTGGTGTGCGCGGCACTTCGTGTGAGATCAGATGCGTCGGATCACAAATTCAAGGCTGGAGATCCAGTGCCGCTTTACGCCAACAAGGTCGGACCGTTTCACAACCCTAGTGAAACATACCGCTACTTTGATCTCCCCTTCTGTTCTCCAGGTAATGTGAAAGATAAAAAGGAAGCTCTTGGTGAAGTACTAAATGGGGATCGTTTGGTTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784006.1
MARRGGGGGWHVIFFLLVCAALRVRSDASDHKFKAGDPVPLYANKVGPFHNPSETYRYFDLPFCSPGNVKDKKEALGEVLNGDRLVSAPYKLDFLADKESEVICKKKLSKKDAAEFRSAVAKDYYFQMYYDDLPIWGFLGKVDKEGKSDPSEYKYYLFKHLHFEIFYNKDRVIEINARTDPNALVDLTDDKEVDVEFMYSAKWKETHVPFEKRMEKYSHSSSLPRHLEIHWFSIINSCVTVLLLTGFLATILMRVLKNDF...

XP_057784007.1
MARRGGGGGWHVIFFLLVCAALRVRSDASDHKFKAGDPVPLYANKVGPFHNPSETYRYFDLPFCSPGNVKDKKEALGEVLNGDRLVSAPYKLDFLADKESEVICKKKLSKKDAAEFRSAVAKDYYFQMYYDDLPIWGFLGKVDKEGKSDPSEYKYYLFKHLHFEIFYNKDRVIEINARTDPNALVDLTDDKEVDVEFMYSAKWKETHVPFEKRMEKYSHSSSLPRHLEIHWFSIINSCVTVLLLTGFLATILMRVLKNDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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