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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002079`

染色体: Chr08 坐标: 18690615-18694551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002079`
名称	SmilChr08G002079
描述	transmembrane 9 superfamily member 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18690615 - 18694551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001560`
GeneID	`131001560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001560`
原始查询	`SmilChr08G002079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 3-like
产物	transmembrane 9 superfamily member 3-like
Arabidopsis	`AT2G01970` (AT2G01970) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814728] identity=87.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0237000` (OJ1081D05.4) - identity=86; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057784008.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057784008.1`
3	Endosome	内体	0.60000	`XP_057784008.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.60000	`XP_057784008.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057784008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18690997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:18691788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:18693968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:18694047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B33
`Chr8:18694077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784008.1

591 aa

296

591

EMP70

PF02990 EMP70 52-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784008.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	52	548	1.2e-179	599.0	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928025.1
TCGGGTGCGTAGTCAATGTCATAATCGCCTCTGCCTAAATCTGTTAATTACGTTAACTTGTTTGCATCCACGCGCTCCTAACCGCGCGTGGCCCTAGCTATTCACAATTCCTTCAAGATTCATCTATCCTGCTCCTTTCTACTACTCGACCTCGAGATCGAGATCTGAGCTTCTTCTCTCTCTACAACTTCTCTCTCTAGAATTTTGTTCGCCTATTTTGTTCGTGTTGAGAAGGTAAACCCCTCTTTCAGTCGGTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001560
ATGGCGAGGGGAGGCTGGCACGTCGTCGTTTTGCTATTGCTCTGCTCTGCGTTCCACGCCGTCAGGTCGGATGGGTCGGATCACAAGTACAAAGTCGGAGATTCGGTGCCGCTCTACGCGAACAAAGTGGGGCCATTTCACAATCCGAGTGAAACTTATCGCTACTTTGATCTCCCATTCTGCTCTACAGGTGAGTTGAAAGATAAAAGTGAAGCTCTCGGTGAAGTGTTGAATGGAGATCGTTTGGTCAGTGCTCCGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784008.1
MARGGWHVVVLLLLCSAFHAVRSDGSDHKYKVGDSVPLYANKVGPFHNPSETYRYFDLPFCSTGELKDKSEALGEVLNGDRLVSAPYKLDFLVDRESEVICKKKLSKKDVAEFRRAVAKDYYFQMYYDDLPIWGFLGKVDKEGKGDPSEYKYYLFKHLHFEIFYNKDRVIEINARTDPNALVDLTEDKEVDVEFMYSAKWKETHVPFEKRMEKYSKSSSLPRHLEIHWFSIINSCVTVLLLTGFLATILMRVLKNDFVKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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