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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002090`

染色体: Chr08 坐标: 18777312-18779746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002090`
名称	SmilChr08G002090
描述	thaumatin-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18777312 - 18779746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001644`
GeneID	`131001644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001644`
原始查询	`SmilChr08G002090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein 1
产物	thaumatin-like protein 1
Arabidopsis	`AT4G38660` (AT4G38660) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830022] identity=55.2; qcov=1.04; evalue=6.03e-114; confidence=high
Rice	`Os09g0536400` - identity=56.2; qcov=1.02; evalue=6.76e-106; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057784183.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057784183.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784183.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784183.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784183.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18777463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B131,B77,C19
`Chr8:18777463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B77,C19
`Chr8:18777534`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A3,B104,B126,B4,C10,C36,C38,C55,C58,D10
`Chr8:18777596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C39
`Chr8:18777622`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A23,A3,B104,B114,B126,B4,C10,C36,C37,C38,C55,C58,C63,D10
`Chr8:18778738`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C35
`Chr8:18778738`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C35
`Chr8:18778797`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C32
`Chr8:18778797`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C32
`Chr8:18778801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:18778824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:18778907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B7,B80,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784183.1

302 aa

151

302

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 28-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784183.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	28	232	1.1e-76	257.9	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928200.1
TAGAGACTAAAAACGGTTAGTCTGTAGTTCACTCATAGGTGCTCATAATTATTCTTGAAAAGAAAAAAGGTGTTCATAATTAAAGATGATCCATTGTCACCTCCCATTCCTCACTCTCACTCCTCTGCACATTCCTCCTCTCTCAGCTCAGCGGAAGTCACACGACTGCTCCGCCGCCGCCGCATCATTCTTCCATTCCTCCTCTCTCAAACACACACACAAAGTTGATCATTCATGGCTACTATTATTTTCACCATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001644
ATGGCTACTATTATTTTCACCATTTTACTGCTCCACATTTTACAAGGCACAGGAGTGTCAGCTGCGAAATTCACATTCGTAAACAAGTGTTCGCACACCATCTGGCCGGCGGTTCTCGGCAGCCCGGCCCTCGAAACCACCGGTTTCGAGCTGCCGGCTGGCGGCTCCCGTGCGTTAGCGGCCCCGGCCGGGTGGTCGGGCCGATTCTGGGCCAGAACCGGCTGCTCCTTCGACGCAGCCGGCCGCGGTTCCTGCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784183.1
MATIIFTILLLHILQGTGVSAAKFTFVNKCSHTIWPAVLGSPALETTGFELPAGGSRALAAPAGWSGRFWARTGCSFDAAGRGSCTTGDCASGRMECGGAGATAATLVEFTLGSSMDFYDVSLVDGYNLPVMIDARGGTGQCASTGCAADLNERCPAELRAGGGGACRSACDAFGTAEYCCKGEYGSPAACKPSAYAQAFKSACPKSYSYAYDDATSTFTCAGGDYVITFCPSQPSQKSSRSKDGSESGSGSVGETVLSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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