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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002095`

染色体: Chr08 坐标: 18834472-18842370 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002095`
名称	SmilChr08G002095
描述	alpha-mannosidase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18834472 - 18842370 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001531`
GeneID	`131001531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001531`
原始查询	`SmilChr08G002095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-mannosidase
产物	alpha-mannosidase
Arabidopsis	`AT5G66150` (AT5G66150) Glycosyl hydrolase family 38 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836747] identity=65.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0140200` - identity=67; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004559 (alpha-mannosidase activity); GO:0006013 (mannose metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00511 (Other glycan degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01074 (Glyco_hydro_38N); PF07748 (Glyco_hydro_38C); PF09261 (Alpha-mann_mid); PF17677 (Glyco_hydro38C2); PF21260 (Laman-like_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057783917.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057783917.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057783917.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783917.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18834967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:18834982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B17,B64
`Chr8:18835101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B47,C87,D3
`Chr8:18835884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:18835887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B47,D11
`Chr8:18835908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:18836148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C11,C69
`Chr8:18836201`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	91	A1,A13,A18,A2,A22,A9,B1,B101,B104,B108,B11,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B121,B125,B129,B131,B133,B139,B2,B21,B25,B27,B29,B3,B32,B34,B36,B39,B4,B40,B45,B46,B50,B52,B53,B58,B60,B62,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B76,B8,B86,B90,B91,B93,B99,C1,C10,C13,C14,C21,C22,C28,C29,C3,C30,C36,C44,C47,C52,C55,C57,C59,C6,C61,C62,C64,C67,C7,C71,C72,C77,C79,C8,D10,D2,D5,D7
`Chr8:18836953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:18837119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B114,C37,C63
`Chr8:18837350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18837361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783917.1

1003 aa

502

1003

Glyco_hydro_38N

Alpha-mann_mid

Laman-like_dom

Glyco_hydro_38C

Glyco_hydro38C2

PF01074 Glyco_hydro_38N 35-349 aa PF09261 Alpha-mann_mid 353-445 aa PF21260 Laman-like_dom 550-571 aa PF07748 Glyco_hydro_38C 598-812 aa PF17677 Glyco_hydro38C2 895-999 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783917.1`	Pfam	`PF01074`	Glyco_hydro_38N	Domain	35	349	1e-85	288.2	Glycosyl hydrolases family 38 N-terminal domain
`XP_057783917.1`	Pfam	`PF09261`	Alpha-mann_mid	Domain	353	445	3.6e-21	75.8	Alpha mannosidase middle domain
`XP_057783917.1`	Pfam	`PF21260`	Laman-like_dom	Domain	550	571	1.9e-07	31.9	Lysosomal alpha-mannosidase-like, central domain
`XP_057783917.1`	Pfam	`PF07748`	Glyco_hydro_38C	Domain	598	812	1.6e-45	156.6	Glycosyl hydrolases family 38 C-terminal domain
`XP_057783917.1`	Pfam	`PF17677`	Glyco_hydro38C2	Domain	895	999	1.1e-08	35.8	Glycosyl hydrolases family 38 C-terminal beta sandwich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927934.1
CTTTCACATTTGTAGGAGAAGAAGTGGGTGGCAATTGGCATGCTCACAGAGAAGCTAAACGTTCTCTCTTCTCATTGCCTTATTCTATACAGAAAAGATCCAAAGCAGTTAAAATATGGAGTAACTACCAAAGAAACCAGCTCCTAACTACACTCCAAAAAGCGGCCTCGGAATGCCCACGCTTCACAATTAATCCTTTTTAAGTTATTTACTTATTGCTGAATGTAAATTATAGGCCGGCACCTACAATTCAAAGAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001531
ATGGGAAGTGTATGTTTGTCAGCTTTTTTAGTATGCATTTTGGGTGTTTTGTGTTGGAATGGAGTTGAAGGGTACGAGACTGGGAGTGGCATTGTGGATGGGAAATTGAATGTGCACTTGGTTCCTCACTCGCACGATGATGTGGGCTGGCTCAAGACTGTCGATCAGTACTACGTTGGCTCCAACAACTCTATTCAGGGTGCTTGCGTGGAGAATGTTCTCGACTCCGTCGTTGTTTCATTGCTTCGTGATCCTAATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783917.1
MGSVCLSAFLVCILGVLCWNGVEGYETGSGIVDGKLNVHLVPHSHDDVGWLKTVDQYYVGSNNSIQGACVENVLDSVVVSLLRDPNRKFIFAEMAFFTRWWREQSQEIQQVVRKLVNAGQLEFVNGGWCMHDEATTHYIDMIDQTTLGHQLIKSQFNKTPRAGWQIDPFGHSAVQGYLLGAELGFDSIHFARIDYQDRAKRMGDKSLEVIWQGSRTFGSSSQIFANAFPHHYSAPDGFNFEVSNSFDPVQDNHLLFDFNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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