当前解析结果
SmilChr08G002104| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002104 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002104 |
| 描述 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 10-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 18891562 - 18892523 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001692 |
|---|---|
| GeneID | 131001692 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001692 |
| 原始查询 | SmilChr08G002104 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 10-like |
| 产物 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 10-like |
| Arabidopsis | AT5G53300 (UBC10)ubiquitin-conjugating enzyme 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835411] identity=84.9; qcov=0.946; evalue=3.21e-67; confidence=high |
| Rice | Os01g0658400 (UBC5A)- identity=84; qcov=0.946; evalue=3.87e-66; confidence=high |
| GO | GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity) |
| KEGG | smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00179 (UQ_con) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001692 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057784250.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057784250.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057784250.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057784250.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784250.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057784250.1PF00179
UQ_con 5-141 aa
XP_057784251.1PF00179
UQ_con 5-105 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057784250.1 |
Pfam | PF00179 |
UQ_con | Domain | 5 | 141 | 3.9e-54 | 182.8 | Ubiquitin-conjugating enzyme |
XP_057784251.1 |
Pfam | PF00179 |
UQ_con | Domain | 5 | 105 | 5.1e-40 | 137.0 | Ubiquitin-conjugating enzyme |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。