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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002105`

染色体: Chr08 坐标: 18894008-18902709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002105`
名称	SmilChr08G002105
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 35A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	18894008 - 18902709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001541`
GeneID	`131001541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001541`
原始查询	`SmilChr08G002105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 35A-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 35A-like
Arabidopsis	`AT1G75850` (VPS35B) VPS35 homolog B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843918] identity=74.3; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0801600` - identity=80; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005770 (late endosome); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030904 (retromer complex); GO:0030906 (retromer, cargo-selective complex); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03635 (Vps35); PF27614 (VPS35L_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783978.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783978.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057783978.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783978.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:18894820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18895030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B7,B80,C48
`Chr8:18895031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B7,B80,C48
`Chr8:18895045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B7,B80,C48
`Chr8:18897994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B108,B71,C80
`Chr8:18898022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:18898205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:18898233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:18898445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:18899307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B2,B24,D7
`Chr8:18900353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:18901508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783978.1

790 aa

395

790

Vps35

VPS35L_N

PF03635 Vps35 13-747 aa PF27614 VPS35L_N 101-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783978.1`	Pfam	`PF03635`	Vps35	Repeat	13	747	4e-288	958.6	Vacuolar protein sorting-associated protein 35
`XP_057783978.1`	Pfam	`PF27614`	VPS35L_N	Repeat	101	159	5.7e-07	29.7	VPS35L

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093965.1
GATTATTTATTTATTATTCCCATCTTTTATTTTTGAGGGAAATTATTCCCATCTTTGGTTTTAACTATTTTTTGCTAAGTTGGGGGTTTGCTAATTAGTTGAAGAATTTTGTCCGTCACAGTGCGCGTGTGTGTGAGAGAGAGAAGGATGATCACTGACGGAGTTGTAGAAGACGAAGAAAAATGGCTGTCAGCTGGGATCGCCGGCCTGCAACAGAATGCCTTCTACATGCATCGCGCTCTCGATTCGAACAATTTGAA...

XM_057927995.1
GATTATTTATTTATTATTCCCATCTTTTATTTTTGAGGGAAATTATTCCCATCTTTGGTTTTAACTATTTTTTGCTAAGTTGGGGGTTTGCTAATTAGTTGAAGAATTTTGTCCGTCACAGTGCGCGTGTGTGTGAGAGAGAGAAGGATGATCACTGACGGAGTTGTAGAAGACGAAGAAAAATGGCTGTCAGCTGGGATCGCCGGCCTGCAACAGAATGCCTTCTACATGCATCGCGCTCTCGATTCGAACAATTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001541
ATGATCACTGACGGAGTTGTAGAAGACGAAGAAAAATGGCTGTCAGCTGGGATCGCCGGCCTGCAACAGAATGCCTTCTACATGCATCGCGCTCTCGATTCGAACAATTTGAAGGATGCTCTCAAGTACTCCGCTCAGATGCTCTCGGAGCTCCGCACTTCGAGGCTCTCCCCTCACAAATACTACGAACTTTATATGAGGGCTTTTGATGAATTGAGGAAATTGGAAATCTTCTTCAAGGAGGAGACTAGTCGTGGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783978.1
MITDGVVEDEEKWLSAGIAGLQQNAFYMHRALDSNNLKDALKYSAQMLSELRTSRLSPHKYYELYMRAFDELRKLEIFFKEETSRGCSIVELYELVQHAGNILPRLYLLCTVGSVYIKSKEAPAKDVLKDLVEMCRGIQHPLRGLFLRSYLSQVSRDKLPDIGSEYEGDADTVMDAVEFVLQNFTEMNKLWVRMQHQGPAREKDKRGKERGELRDLVGKNLHVLSQIEGVDLEMYKEIVLPRVLEQVVNCKDELAQYYLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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