当前解析结果
SmilChr08G002119| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002119 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002119 |
| 描述 | protein S-acyltransferase 10 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 19059956 - 19066897 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001624 |
|---|---|
| GeneID | 131001624 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001624 |
| 原始查询 | SmilChr08G002119 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein S-acyltransferase 10 |
| 产物 | protein S-acyltransferase 10 |
| Arabidopsis | AT3G51390 (AT3G51390)DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824302] identity=55.2; qcov=1; evalue=3.34e-122; confidence=high |
| Rice | Os12g0480000- identity=49.8; qcov=0.839; evalue=2.33e-101; confidence=high |
| GO | GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01529 (DHHC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001624 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.80000 | XP_057784145.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057784145.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057784145.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784145.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784145.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:19060248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,A25,C70 |
Chr8:19060296 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:19061554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,C71 |
Chr8:19062285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B54,C12,C71 |
Chr8:19064493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C52 |
Chr8:19064493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057784145.1PF01529
DHHC 181-299 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057784145.1 |
Pfam | PF01529 |
DHHC | Family | 181 | 299 | 6.3e-31 | 107.9 | DHHC palmitoyltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。