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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002122`

染色体: Chr08 坐标: 19096084-19096746 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002122`
名称	SmilChr08G002122
描述	uncharacterized SmilChr08G002122
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19096084 - 19096746 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998160`
GeneID	`130998160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998160`
原始查询	`SmilChr08G002122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829722]; symbol=DAZ3; hit=AT4G35700; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829722]; symbol=DAZ3; hit=AT4G35700; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G35700` (DAZ3) zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829722] identity=62.5; qcov=0.182; evalue=4.11e-11; confidence=weak
Rice	`Os02g0293900` (OJ1057_D08.30) - identity=59.4; qcov=0.145; evalue=4.3e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779576.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779576.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779576.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779576.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19096104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D11
`Chr8:19096138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:19096160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C87,D11
`Chr8:19096176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:19096188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A7,B135,C33
`Chr8:19096247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C71
`Chr8:19096289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C22,C32,C68
`Chr8:19096303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A7,B135,B40,C33
`Chr8:19096345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B135,B23,C18,C44
`Chr8:19096363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B117,B27,B58,C39
`Chr8:19096422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C87
`Chr8:19096479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C36,C38,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779576.1

220 aa

110

220

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 144-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779576.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	144	166	6e-08	33.2	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923593.1
ATGAGCAACAGCGACGCCGCCGGCAATGAGAGCTCTTCGTCCAACCCCATCCCGCCGCCCACCGATGAGAGCCCCCGCCTTGCTCCTCGTCACAGCCCTCATGGCCGCGGCTCTTCTCCGATGCATTCCTGGGAAATGGCCCTCTTCTCTCCGCCGCCACCGCGCACTCCCCCGATCATTGGAGCCCCGGGCCGGACGGCTTTCGGGCCTTACAGGCCGCCGGCCCCGCAGTGGCCGTCGACGGGCCCTAGCGGCAGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998160
ATGAGCAACAGCGACGCCGCCGGCAATGAGAGCTCTTCGTCCAACCCCATCCCGCCGCCCACCGATGAGAGCCCCCGCCTTGCTCCTCGTCACAGCCCTCATGGCCGCGGCTCTTCTCCGATGCATTCCTGGGAAATGGCCCTCTTCTCTCCGCCGCCACCGCGCACTCCCCCGATCATTGGAGCCCCGGGCCGGACGGCTTTCGGGCCTTACAGGCCGCCGGCCCCGCAGTGGCCGTCGACGGGCCCTAGCGGCAGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779576.1
MSNSDAAGNESSSSNPIPPPTDESPRLAPRHSPHGRGSSPMHSWEMALFSPPPPRTPPIIGAPGRTAFGPYRPPAPQWPSTGPSGSRGLGFQAVPVGGRGGGVVAAAGGLHIGGCPSGRKRGREGGVGSSSGGNRVGEGGVQHCSVCNKGFGSSKALFGHMRSHPDRGWKGVHPPPAFRAEEEFADLHVAPEAEAEPEAGEDENNYRVPDLNQPPPPDSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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