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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002123`

染色体: Chr08 坐标: 19097564-19099178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002123`
名称	SmilChr08G002123
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19097564 - 19099178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001597`
GeneID	`131001597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001597`
原始查询	`SmilChr08G002123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=29.9; qcov=1.09; evalue=3.56e-68; confidence=low
Rice	`Os09g0422000` (HCT3) - identity=25.1; qcov=1.06; evalue=1.12e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784085.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784085.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784085.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784085.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19097790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:19097813`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B108,B121,B27,B69,B71,C56,C78,C80,D5
`Chr8:19097826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C52,C83,D4
`Chr8:19097878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:19097943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr8:19098033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A5,B100,B103,B138,B85,C10,C34,C35,C38,C56,D1,D9
`Chr8:19098037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:19098079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B120,B39
`Chr8:19098079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B39
`Chr8:19098098`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,C41
`Chr8:19098098`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:19098103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784085.1

429 aa

214

429

Transferase

PF02458 Transferase 2-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784085.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	2	417	1.7e-67	228.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928102.1
TAAATAAAGTGTACGTAAGTAGCTGTATATTGTCTTGTATAGCTATATGTCATTCAATTCATATCGATCTAATTTGGCCTGACTATTCTCAAAGCTATGGACAATTACTCTATTTAAAAGGGGGATTAATAACTAAGCTGATGAGTAACTAAAAAGGTAGAAAAAAAAAAAAAATGGAATGCGAGATGATTTCAATGGAGAAAATAAAGCCGGCTTCAGCAACACCTCATCACCTTAGAATCTACAAGATCTCCCTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001597
ATGGAATGCGAGATGATTTCAATGGAGAAAATAAAGCCGGCTTCAGCAACACCTCATCACCTTAGAATCTACAAGATCTCCCTGCTCGATCAGTTGGTGCTTCATGCCTACGCCTCAGTAATTTTATTCTTCTCCGGCAGCAGCGGCGGCAGCAGCCTACAGCATCTAAAGGATTCACTTTCTCAAACTCTGGCCACCTTTTATCCGTTGGCCGGAGTCGTGAGAGACGCCTTGTCTGTAGACTGCAACGACCAAGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784085.1
MECEMISMEKIKPASATPHHLRIYKISLLDQLVLHAYASVILFFSGSSGGSSLQHLKDSLSQTLATFYPLAGVVRDALSVDCNDQGLVFYVAKVKGEIRDFLQNPNIELMNKFLPGGCNPEKPPCPGDNVMVIRLNCFDCGGIAMSIMFDHCVADLNSISTFLRCWAANARGCDQVSTLNCIAQSSFPQKPSLPRNLVPVYNLMKYWSVGKFVMRRYVFNASALSILKAELSSGGATPSRVDVVTAVIWKSFMAAAAADS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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