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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002124`

染色体: Chr08 坐标: 19112277-19118582 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002124`
名称	SmilChr08G002124
描述	phosphoinositide phosphatase SAC6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19112277 - 19118582 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001557`
GeneID	`131001557`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001557`
原始查询	`SmilChr08G002124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoinositide phosphatase SAC6-like
产物	phosphoinositide phosphatase SAC6-like
Arabidopsis	`AT5G66020` (ATSAC1B) Phosphoinositide phosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836732] identity=62.8; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0554300` - identity=56.9; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0043812 (phosphatidylinositol-4-phosphate phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02383 (Syja_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001557

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057784004.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057783998.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783998.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057784004.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19112511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C8
`Chr8:19112897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B22,B51,C35
`Chr8:19112909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:19113040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B79,B83,C13,C47
`Chr8:19113385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:19114072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr8:19115365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C8
`Chr8:19115569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:19115596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B52,B72,B76
`Chr8:19115968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A25,C46,C70
`Chr8:19115977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C15
`Chr8:19116236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783998.1

601 aa

300

601

Syja_N

PF02383 Syja_N 68-355 aa

XP_057783999.1

597 aa

298

597

Syja_N

PF02383 Syja_N 68-351 aa

XP_057784000.1

572 aa

286

572

Syja_N

PF02383 Syja_N 68-192 aa PF02383 Syja_N 199-326 aa

XP_057784001.1

570 aa

285

570

Syja_N

PF02383 Syja_N 68-355 aa

XP_057784002.1

497 aa

248

497

Syja_N

PF02383 Syja_N 16-251 aa

XP_057784004.1

484 aa

242

484

Syja_N

PF02383 Syja_N 6-238 aa

XP_057784005.1

484 aa

242

484

Syja_N

PF02383 Syja_N 6-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783998.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	68	355	2.1e-77	261.2	SacI homology domain
`XP_057783999.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	68	351	1.3e-78	265.2	SacI homology domain
`XP_057784000.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	68	192	8.3e-63	213.3	SacI homology domain
`XP_057784000.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	199	326	8.3e-63	213.3	SacI homology domain
`XP_057784001.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	68	355	1.8e-77	261.4	SacI homology domain
`XP_057784002.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	16	251	2.5e-66	224.9	SacI homology domain
`XP_057784004.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	6	238	1.3e-65	222.5	SacI homology domain
`XP_057784005.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	6	238	1.3e-65	222.5	SacI homology domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928018.1
TATTTCAGTTATTGCAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGACTCCATTCACTCACAAAACTCATTCTTCATTTGGTTTCGGAATCAAAGTAATTAGATTTGGGAAAAAATATAAGAATAATGATGGAGAAGGCTGATCCGGTGGTGCAGAAGGTGTATAATAGAATGCGGCTGTGGGAATTCCCAGAGCAATATCTGGTGGAGCCCAGCGATGGCTCCTCCGCTCCCTTTCTCGCCATCAGCCGCTACAATG...

XM_057928015.1
GTTATTGCAGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGACTCCATTCACTCACAAAACTCATTCTTCATTTGGTTTCGGAATCAAAGTAATTAGATTTGGGAAAAAATATAAGAATAATGATGGAGAAGGCTGATCCGGTGGTGCAGAAGGTGTATAATAGAATGCGGCTGTGGGAATTCCCAGAGCAATATCTGGTGGAGCCCAGCGATGGCTCCTCCGCTCCCTTTCTCGCCATCAGCCGCTACAATGGCTCTTT...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC131001557
ATGATGGAGAAGGCTGATCCGGTGGTGCAGAAGGTGTATAATAGAATGCGGCTGTGGGAATTCCCAGAGCAATATCTGGTGGAGCCCAGCGATGGCTCCTCCGCTCCCTTTCTCGCCATCAGCCGCTACAATGGCTCTTTCTCTATCATCGACGAGCTACCGCAGTTGAGTTCTCATCGCGCTCCAAAAATCTGGACCATCTTCGGAGTGGTTGGGACTCTGAAGCTCTTTGCAGGCATTTATTTGCTAGTGATAACGGA...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057783998.1
MMEKADPVVQKVYNRMRLWEFPEQYLVEPSDGSSAPFLAISRYNGSFSIIDELPQLSSHRAPKIWTIFGVVGTLKLFAGIYLLVITERESAGTYVDKPIFRISSMKIFPCDLSLKHAPEEHNRMEREFSQLLYIAETTPGLYFSYEVNLTLSLQRLHDLSEESKLLPLWRQADPRFLWNSYMSELLIDNKLDPYLLPVMQGSFKSFQYALGENILDVTLIARRCNRRTGTRMWTRGADSDGFVANFIETEQIIQLNGHIA...

XP_057783999.1
MMEKADPVVQKVYNRMRLWEFPEQYLVEPSDGSSAPFLAISRYNGSFSIIDELPQLSSHRAPKIWTIFGVVGTLKLFAGIYLLVITERESAGTYVDKPIFRISSMKIFPCDLSLKHAPEEHNRMEREFSQLLYIAETTPGLYFSYEVNLTLSLQRLHDLSEESKLLPLWRQADPRFLWNSYMSELLIDNKLDPYLLPVMQGSFKSFQYALGENILDVTLIARRCNRRTGTRMWTRGADSDGFVANFIETEQIIQLNGHIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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