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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002137`

染色体: Chr08 坐标: 19245865-19247284 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002137`
名称	SmilChr08G002137
描述	sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	19245865 - 19247284 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001614`
GeneID	`131001614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001614`
原始查询	`SmilChr08G002137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial
产物	sufE-like protein 1%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G26500` (CPSUFE) chloroplast sulfur E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828756] identity=60.7; qcov=0.935; evalue=1.37e-135; confidence=high
Rice	`Os09g0270900` (OsISC3) - identity=48.7; qcov=0.782; evalue=7.82e-75; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01722 (BolA); PF02657 (SufE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784124.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057784124.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784124.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784124.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:19246147`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	115	A1,A14,A16,A20,A25,A5,A6,A7,A9,B103,B106,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B137,B139,B140,B16,B19,B21,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B38,B44,B48,B5,B52,B58,B60,B66,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B79,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B91,B96,B97,B99,C10,C12,C13,C14,C19,C2,C21,C26,C28,C3,C30,C31,C34,C35,C37,C38,C44,C45,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C69,C70,C76,C77,C79,C80,C82,C83,C84,C85,D1,D4,D6
`Chr8:19246343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B45
`Chr8:19246354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:19246366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C61
`Chr8:19246383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B57,C34,C36
`Chr8:19246387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B42,B43
`Chr8:19246397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B106,B21,B60,C38
`Chr8:19246401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B41,B7,B80,D10
`Chr8:19246414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A9,B101
`Chr8:19246425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:19246489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:19246509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784124.1

386 aa

193

386

SufE

BolA

PF02657 SufE 116-241 aa PF01722 BolA 304-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784124.1`	Pfam	`PF02657`	SufE	Domain	116	241	1.2e-42	145.4	Fe-S metabolism associated domain
`XP_057784124.1`	Pfam	`PF01722`	BolA	Family	304	382	7.8e-31	106.9	BolA-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928141.1
AAAAATTTAAAACAGGAGATGATGAGTAATTTTGATTTTGTGGAGATGAGTAACAAAATGAAATGTATTTCATCATCCATAAACTCTCGTCTCTCCATCCTCCACCAACCCTCTCTCTCTCAAAAAATTTCACTCTTCAATCGTAAACTCATGTCAATTCCCACTAAAATTCCCATTTCTTCCCTCTCCGCCGCTCCATTCCTCAACCCCGCAAAAACCCCCACACCGCCTCACAGATTCTTCTTCTTCTCCAAGAACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001614
ATGATGAGTAATTTTGATTTTGTGGAGATGAGTAACAAAATGAAATGTATTTCATCATCCATAAACTCTCGTCTCTCCATCCTCCACCAACCCTCTCTCTCTCAAAAAATTTCACTCTTCAATCGTAAACTCATGTCAATTCCCACTAAAATTCCCATTTCTTCCCTCTCCGCCGCTCCATTCCTCAACCCCGCAAAAACCCCCACACCGCCTCACAGATTCTTCTTCTTCTCCAAGAACATCACCTTTCAAAGAATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784124.1
MMSNFDFVEMSNKMKCISSSINSRLSILHQPSLSQKISLFNRKLMSIPTKIPISSLSAAPFLNPAKTPTPPHRFFFFSKNITFQRISTKQPVFSAPPSASSSVSLQPVEELPPKLQEIVKLFQAVEEPKAKYEQLLFYGRNLNPLESNYKTSENKVQGCVSQVWVRAYFDEDKNVIFEADSDSMLTKGLAALLVQGLSGRPVEEIVRVSPDFAMLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALQLYVEAERGASPSSDSSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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